深圳湾实验室坪山生物医药研发转化中心李子刚获国家专利权
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龙图腾网获悉深圳湾实验室坪山生物医药研发转化中心申请的专利联合掩码语言建模和酵母表面展示的多肽设计方法及序列获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN117133358B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-02-03发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202311074037.4，技术领域涉及：G16B25/10；该发明授权联合掩码语言建模和酵母表面展示的多肽设计方法及序列是由李子刚;刘志宏;尹丰;叶宇鑫;窦俊;李聪;陈杰;聂志伟;刘雨田设计研发完成，并于2023-08-24向国家知识产权局提交的专利申请。
本联合掩码语言建模和酵母表面展示的多肽设计方法及序列在说明书摘要公布了：本发明的一种联合掩码语言建模和酵母表面展示的多肽设计方法及序列，包括对蛋白质序列数据库进行清洗，选择符合要求的蛋白质序列作为语言模型的训练集，并在训练集所包含的蛋白质序列上进行掩码语言建模；在预训练模型的基础上设计设定的下游任务，并进行下游任务微调；对一条选定的参考序列进行随机的残基掩盖，并预测被遮盖的残基；对模型生成的多肽候选物进行虚拟筛选；通过酵母展示技术对筛选后的多肽进行蛋白表达水平和亲和力的测定。本发明通过将自然语言处理技术迁移至多肽生成领域，可大量生成有可能具有特定性质或功能的多肽候选物，结合人工智能生成、虚拟筛选和湿实验表征，搭建了较为完整的“干湿结合”的设计流程。
本发明授权联合掩码语言建模和酵母表面展示的多肽设计方法及序列在权利要求书中公布了：1.一种联合掩码语言建模和酵母表面展示的多肽设计方法，其特征在于，通过以下步骤， 对可公开获取的蛋白质序列数据库进行清洗，选择符合要求的蛋白质序列作为语言模型的训练集，并在训练集所包含的蛋白质序列上进行掩码语言建模即建立预训练模型进行掩码重建预训练； 在预训练模型的基础上设计设定的下游任务，通过所述下游任务的训练更新预训练模型的参数，将设定的性质或者功能信息存储到模型参数中，即进行下游任务微调； 对一条选定的参考序列进行随机的残基掩盖，并预测被遮盖的残基，从而得到新的多肽序列； 通过人工设定的规则和分子动力学模拟对模型生成的多肽候选物进行虚拟筛选； 通过酵母展示技术对筛选后的多肽进行蛋白表达水平和亲和力的测定。
如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术，可联系本专利的申请人或专利权人深圳湾实验室坪山生物医药研发转化中心，其通讯地址为：518118 广东省深圳市坪山区坑梓街道兰景路16号国富文化产业厂区；或者联系龙图腾网官方客服，联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。
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