重庆市畜牧科学院;生猪技术创新中心(重庆)徐顺来获国家专利权
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龙图腾网获悉重庆市畜牧科学院;生猪技术创新中心(重庆)申请的专利一种基于SNP标记的地方畜禽品种鉴定方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN121030379B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-01-27发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202511562969.2,技术领域涉及:G06F18/2321;该发明授权一种基于SNP标记的地方畜禽品种鉴定方法是由徐顺来;肖聪;刘勇;唐强;李益;高庭玥设计研发完成,并于2025-10-30向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于SNP标记的地方畜禽品种鉴定方法在说明书摘要公布了:本发明提供一种基于SNP标记的地方畜禽品种鉴定方法,涉及品种鉴定领域,包括:步骤S1、基因型数据获取,步骤S2、基因型数据质控,步骤S3、建立品种鉴定标准库,步骤S4、血统含量评估。该方法基于基因组SNP标记血统含量评估的标准化分子鉴定分析流程,通过分析核心SNP位点的基因型信息,实现从原始基因分型数据到品种身份判定的分析全流程处理,该方法能够为我国地方畜禽遗传资源的保护与利用、种质创新与产业化发展提供标准化、便捷高效的分子检测技术支撑。
本发明授权一种基于SNP标记的地方畜禽品种鉴定方法在权利要求书中公布了:1.一种基于SNP标记的地方畜禽品种鉴定方法,其特征在于:包括: 步骤S1、基因型数据获取:通过地方畜禽品种样品收集确定鉴定的目标品种,并采用SNP芯片或重测序方法进行基因分型; 步骤S2、基因型数据质控:采用分层过滤策略、对获取的数据进行过滤; 步骤S3、建立品种鉴定标准库:采用主成分分析和进化树分析解析群体遗传结构,识别并提出潜在杂交渗入个体; 步骤S4、血统含量评估:对待测个体进行采样、基因测序、质控,合格的数据与品种鉴定标准库数据合并;然后基于监督聚类算法建立血统含量评估模型、对待测样品的血统含量进行计算; 其中步骤S3中所述进化树分析采用如下邻接法构建系统进化树: 遗传距离矩阵的计算包括等位基因遗传距离和个体间遗传距离,其中,等位基因遗传距离采用基于等位基因频率差异的欧氏距离计算品种间成对的遗传距离;个体间遗传距离通过所有等位基因遗传距离计算所有个体两两间的遗传距离,后续基于个体距离计算品种平均距离用于构建系统进化树; 系统发育树重建:依据个体间遗传距离矩阵采用邻接法构建进化树;并基于最小进化原理、通过迭代合并距离最近的分类单元,逐步生成无根树; 树搜索与优化:通过搜索使观测数据出现概率最大的树拓扑和分支长度;基于先验分布和观测数据,通过马尔可夫链蒙特卡洛采样获得树的后验概率分布,以最大后验概率树或共识树作为结果; 节点支持度评估包括自举法与后验概率;其中,自举法通过对位点进行有放回重抽样,重建多棵自举树,计算各节点在自举树中出现的频率,评估拓扑结构的稳健性;后验概率直接从MCMC采样中获取各节点的后验概率; 纯种判定标准:a、同一品种个体应形成高支持率单系群;b、删除位于外源畜禽种分支或混合分枝的个体;c、删除同品种最近共同祖先遗传距离大于群体平均距离2倍的边缘个体。
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