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河南华之源智造科技有限公司刘航获国家专利权

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龙图腾网获悉河南华之源智造科技有限公司申请的专利一种生物纳米孔对DNA核酸生物体进行确定的数据处理方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119673285B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-01-27发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411620507.7,技术领域涉及:G16B30/10;该发明授权一种生物纳米孔对DNA核酸生物体进行确定的数据处理方法是由刘航;刘笑笑;陈波;雷炳旭;檀飞飞;李易通设计研发完成,并于2024-11-14向国家知识产权局提交的专利申请。

一种生物纳米孔对DNA核酸生物体进行确定的数据处理方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种生物纳米孔对DNA核酸生物体进行确定的数据处理方法,从原始电流数据的采集到最终DNA碱基序列的生成和生物体的确定,涵盖了数据修正、噪声过滤、event筛选、level查找、序列比对等一系列关键步骤,构建了一套完整的数据处理流程,实现了生物纳米孔电流信号的全面处理和分析,采用边采集边分析的方式,可以实时获取DNA序列信息,大大提高了检测效率。不需要等到全部数据采集完成才进行分析,节省了大量时间;以生物纳米孔为检测手段,样本制备要求低,无需复杂的样品处理,数据分析流程清晰明了。

本发明授权一种生物纳米孔对DNA核酸生物体进行确定的数据处理方法在权利要求书中公布了:1.一种生物纳米孔对DNA核酸生物体进行确定的数据处理方法,其他特征在于,包括以下步骤: 步骤一,根据生物纳米孔的特性,将待检测DNA序列划分为若干个碱基的组合,然后对待检测DNA序列进行生物纳米孔检测;得到待检测DNA序列的原始电流变化数据; 步骤二,通过修正算法对原始电流变化数据中的无效值进行修正; 步骤三,对修正后的电流变化数据进行高频噪声过滤处理; 步骤四,将处理后的电流变化数据分为开孔电流和阻塞电流,并筛选符合条件的event; 所述event是指当有DNA过孔产生的阻塞电流事件,event的筛选包括以下步骤: 步骤1,首先根据一个宽泛的阈值检测,选择提取event的持续时间Time1S,且电流范围在检测到的开孔电流的0.1至0.75之间的; 步骤2,根据检测到的event的个数和检测到的开孔电流进行数据初始化本地开孔电流值; 步骤3,然后根据每一个本地开放态和每一个Event进行逐个分析和进一步筛选适合的event; 所述event进一步筛选包括以下步骤: 步骤1,通过检测event中每一个编号的event的前后状态:event_before和event_after,分别代表event前后的开放状态,初始值为NaN; 步骤2,如果event不是第一个状态,则计算event前的开放态的中值为event_before,如果Event不是最后一个状态,则计算event后一个状态的中值为event_after; 步骤3,如果当前event编号大于2,并且前两个开放态均存在数据,则尝试使用指数衰减函数拟合前一个状态的数据,更新为event_before; 步骤4,如果当前event编号小于开放态编号,并且当前状态存在数据,则尝试使用指数衰减函数拟合后一个状态的数据,更新为event_after; 步骤5,异常处理,如果event_before和event_after异常偏离出event检测到的开放态电流的3sigma的值,也将其设置为NaN; 步骤五,对查找的符合条件的event进行level查找和拟合;首先识别level,确定不同碱基组合产生的电流阻Level的边界,然后去除虚假的level; 步骤六,建立参考level数据库,选择已知序列的DNA样本作为测试集,对其进行纳米孔测序和level提取,将测试集样本的level数据与参考level数据库进行比对,得到注释后的DNA序列,将注释后的DNA序列与测试集样本已知的实际序列进行比对,计算序列相似度,析错配碱基的类型和来源,评估参考数据库的准确性,据评估结果对参考数据库进行优化和改进; 步骤七,以Needleman-Wunsch和Smith-Waterman序列比对算法为基础,将步骤五中待检测DNA测序得到的level数据与参考level数据库中的level数据进行比对,找到最相似的序列,推断出待检测DNA的DNA序列,将新测得的DNA序列的level补充到参考level数据库中,并重新计算不同序列组合的中值,以更新和完善参考level数据库,提高其准确度。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人河南华之源智造科技有限公司,其通讯地址为:450000 河南省郑州市河南自贸试验区郑州片区(郑东)明理路与白佛南路交叉口中原金融产业园一期一号楼;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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