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杭州联川生物技术股份有限公司陈哲名获国家专利权

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龙图腾网获悉杭州联川生物技术股份有限公司申请的专利一种单细胞转录组细胞碎片和多细胞过滤方法、介质和设备获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116805511B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-01-27发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310181167.1,技术领域涉及:G16B35/00;该发明授权一种单细胞转录组细胞碎片和多细胞过滤方法、介质和设备是由陈哲名;郎秋蕾;韩斐然设计研发完成,并于2022-11-03向国家知识产权局提交的专利申请。

一种单细胞转录组细胞碎片和多细胞过滤方法、介质和设备在说明书摘要公布了:本发明公开了一种单细胞转录组低质量细胞过滤方法,涉及涉及生物数据处理方法。包括以下步骤:对细胞进行分群;按基因取表达量平均值,生成细胞群的特征表达谱;将所述细胞群的特征表达谱随机两两组合,生成人工多细胞;合并所述人工多细胞表达谱和真实细胞表达谱,计算每个细胞间的距离;在规定范围内设置若干等距的邻域,计算每个邻域下,每个真实细胞在邻域内的人工多细胞比例;统计每个邻域下的人工多细胞比例分布,求其双峰系数,并以双峰系数最大的邻域为最优邻域;在最优邻域下,将人工多细胞比例最大的规定数量的真实细胞认定为多细胞,将其从真实细胞表达谱中删除。提高了单细胞转录组数据的过滤标准和精准度,增强了数据的可靠性。

本发明授权一种单细胞转录组细胞碎片和多细胞过滤方法、介质和设备在权利要求书中公布了:1.一种单细胞转录组细胞碎片和多细胞过滤方法,其特征在于,包括以下步骤: S101,基于真实细胞表达谱,对细胞进行分群; 将基因分别设置四个基因集Agene、Amt、Aactive、Aantioxi,并计算每个细胞群的表达基因分数Sgene、线粒体分数Smt、活性分数Sactive、抗氧化分数Santioxi;Agene为一次过滤细胞表达谱中的总基因集,Sgene为细胞群中所有细胞的表达基因数量的平均值;Amt为对应物种的线粒体基因集合,Smt为细胞群中所有细胞的Amt基因表达比例的平均值;Aactive为对应物种的管家基因集合,Sactive为细胞群中所有细胞的Aactive基因平均表达量的平均值;Aantioxi为对应物种的抗氧化基因集合,Santioxi为细胞群中所有细胞的Aantioxi基因平均表达量的平均值;设置Sgene、Smt、Sactive、Santioxi对应的阈值Ggene、Gmt、Gactive、Gantioxi,并判定细胞群类型;在真实细胞表达谱中,当Sgene分数小于Ggene时,判定细胞群为细胞碎片,将判定为细胞碎片的细胞删除; S1041,将每个细胞群的细胞表达谱,按基因取表达量平均值,生成每一细胞群的特征表达谱; S1042,将所述细胞群的特征表达谱随机两两组合,生成一定数量的人工多细胞; S1043,合并所述人工多细胞表达谱和真实细胞表达谱,计算每个细胞间的距离; S1044,在规定范围内设置若干等距的邻域,计算每个邻域下,每个真实细胞在邻域内的人工多细胞比例; S1045,统计每个邻域下的人工多细胞比例分布,求其双峰系数,并以双峰系数最大的邻域为最优邻域; S1046,在最优邻域下,将人工多细胞比例最大的规定数量的真实细胞认定为多细胞,将其从真实细胞表达谱中删除; 所述双峰系数为: 其中,为双峰系数;和分别为人工多细胞比例分布的偏度和峰度;为真实细胞数。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人杭州联川生物技术股份有限公司,其通讯地址为:310018 浙江省杭州市杭州经济技术开发区6号大街260号16幢四层;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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