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青岛国际旅行卫生保健中心(青岛海关口岸门诊部)杜建森获国家专利权

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龙图腾网获悉青岛国际旅行卫生保健中心(青岛海关口岸门诊部)申请的专利基于聚类分析的哨点基因库数据处理方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120808879B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-01-23发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202511299651.X,技术领域涉及:G16B25/00;该发明授权基于聚类分析的哨点基因库数据处理方法是由杜建森;李西峰;赵风源;王璐;田桢干;田绿波;李刚;毕鹏飞设计研发完成,并于2025-09-12向国家知识产权局提交的专利申请。

基于聚类分析的哨点基因库数据处理方法在说明书摘要公布了:本发明属于数据处理技术领域,本发明公开了基于聚类分析的哨点基因库数据处理方法,包括:提取哨点基因库中样本的基因表达数据,构建静态特征空间和动态时序空间;对静态特征空间进行初步聚类,得到初始静态分组;在各静态分组内切换至动态时序空间,基于时间序列相似性对组内样本执行二次聚类,细化为动态演化亚组;为每个动态演化亚组拟合基因表达随时间变化的动态轨迹模型,在静态特征空间中计算样本与对应动态轨迹模型预测值的偏离度,将偏离度超过预设置信区间的样本标记为异常样本;进一步拓展了哨点基因库在生物医学研究中的应用场景与价值。

本发明授权基于聚类分析的哨点基因库数据处理方法在权利要求书中公布了:1.基于聚类分析的哨点基因库数据处理方法,其特征在于,包括: S1、提取哨点基因库中样本的基因表达数据,构建静态特征空间和动态时序空间; 所述构建静态特征空间和动态时序空间的方法包括: 基于基因表达数据,将样本在预设固定时间点的基因表达值作为特征输入,经过标准化与特征降维处理,得到样本静态特征矢量,形成表征样本在静态时间截面上分子状态的静态特征空间; 同时在动态时序空间中,将样本在不同连续时间点上的基因表达数据按时间顺序排列,组织为多维时间序列;通过主成分分析法将处理后的时间序列映射为低维轨迹矢量,作为样本在动态时序空间中的坐标点,嵌入构成动态时序空间; S2、对静态特征空间进行初步聚类,得到初始静态分组;在各静态分组内切换至动态时序空间,基于时间序列相似性对组内样本执行二次聚类,细化为动态演化亚组; 所述对组内样本执行二次聚类的方法包括: 针对属于同一初始静态分组的样本,提取在不同连续时间点的基因表达数据,形成时间序列轨迹;通过余弦相似度方法对样本间的时间序列进行相似性度量,并基于相似性度量结果构建组内样本的相似性矩阵; 基于相似性矩阵,采用时间序列聚类方法对样本进行二次聚类,将处于同一初始静态分组的样本细化为不同的动态演化亚组,每个动态演化亚组对应一类在时间维度上具有相似基因表达演化轨迹的样本; S3、为每个动态演化亚组拟合基因表达随时间变化的动态轨迹模型,在静态特征空间中计算样本与对应动态轨迹模型预测值的偏离度,将偏离度超过预设置信区间的样本标记为异常样本; 所述计算样本与对应动态轨迹模型预测值的偏离度的方法包括: 在任一时间点,提取静态特征空间中样本的基因表达值,与该样本所属的动态轨迹模型在对应时间点的预测值进行对比,计算二者的差值作为残差,并将该残差的绝对值按照对应时间点所属动态演化亚组内的残差标准差进行归一化,得到归一化偏差值;对所有时间点的归一化偏差值取平均,得到样本在整个时间序列上的总体偏离度,进而作为该样本与对应动态轨迹模型预测值的偏离度; S4、以动态演化亚组为核心节点,异常样本为独立节点,依据轨迹特征相似性计算各节点间关联强度,并以关联强度为边构建哨点基因动态图谱; 所述异常样本的获取方法包括: 在动态演化亚组内对所有样本的残差进行统计分析,通过计算残差在各维度上的协方差,得到该时间点的残差协方差矩阵;分别对动态轨迹模型和样本的基因表达值进行参数化拟合,获取动态轨迹模型的摘要参数矢量和样本的估计参数矢量,进而计算获取跨空间一致性偏离度; 当样本与对应轨迹模型预测值之间的偏离度和跨空间一致性偏离度均超过对应的预设置信区间时,判定该样本为异常样本; 将每个动态演化亚组作为核心节点,每个异常样本作为独立节点;对于每个节点,提取在时间序列上的动态轨迹特征;在任意两个节点之间,采用余弦相似度计算动态轨迹特征相似性,进而获取各节点间的关联强度; 将计算得到的关联强度作为哨点基因动态图谱中,节点之间连接边的权重进行表示;当两个节点间关联强度大于等于预设关联强度阈值时,在这两个节点之间建立一条连接边,并将连接边的权重设置为这两个节点之间的关联强度值;若异常样本所对应的独立节点与任何核心节点的关联强度均小于预设关联强度阈值时,则保持孤立;将所有节点及其连接边组成加权无向图,进而获取哨点基因动态图谱。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人青岛国际旅行卫生保健中心(青岛海关口岸门诊部),其通讯地址为:266000 山东省青岛市市南区福州南路85号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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