中国农业科学院北京畜牧兽医研究所赵福平获国家专利权
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龙图腾网获悉中国农业科学院北京畜牧兽医研究所申请的专利基于改进基因组特征主成分回归的大白猪基因组预测方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119380804B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-01-06发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411329706.2,技术领域涉及:G16B20/20;该发明授权基于改进基因组特征主成分回归的大白猪基因组预测方法是由赵福平;史良玉;王立贤;高红梅;石丽君设计研发完成,并于2024-09-24向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于改进基因组特征主成分回归的大白猪基因组预测方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于改进基因组特征主成分回归的大白猪基因组预测方法,定义为GF_PCR的该方法将传统的PCR方法分成两个部分,对基因组特征部分进行简单回归,对剩余SNPs进行PCR分析。当基因组特征中包含较多致因突变时,该模型能够获得更高基因组预测准确性。同时,使得达100Kg体重日龄性状使用GF_PCR模型基因组预测准确性比PCR模型高,原因是致因突变在预选基因组特征中的比例较大,则GF_PCR进一步提高了基因组预测准确性。
本发明授权基于改进基因组特征主成分回归的大白猪基因组预测方法在权利要求书中公布了:1.一种基于改进基因组特征主成分回归的大白猪基因组预测方法,其特征在于,步骤包括: S1,筛选基因组预测样本个体,并对筛选后的样本个体做校正表型计算; S2,构建结合基因组和系谱信息的全基因组关联分析模型,以所述全基因组关联分析模型分析得到包含基因组和系谱信息的基因组特征; S3,使用改进的基因组特征主成分回归方法构建基因组预测模型,并以步骤S2分析到的所述基因组特征为模型输入,得到模型输出的校正后表型值; 其中,构建的所述基因组预测模型通过如下表达式1-13表达: ;1-13 表达式1-13中,为达100kg体重日龄、或达100kg体重校正背膘厚或总产仔数校正后表型值,为分析群体的均值,为元素为1的向量,为基因组特征矩阵,为基因组特征相应效应向量,为根据基因型值构建的设计矩阵,为个体基因组育种值向量,服从,其中为基因组亲缘关系矩阵,为加性遗传方差,为随机残差,服从分布,其中为单位矩阵,为残差方差; S4,将基因组特征作为协变量从校正后表型值剖分后,育种值与剩余残差组成新的校正后表型,即: ;1-14 其中,为p×1的剩余多基因组特征效应,其方差,表示单位矩阵,表示剩余多基因组特征效应方差,p表示表示所选择剩余多基因型组特征效应个数,为n×p的剩余多基因型组特征效应矩阵,表示具有芯片个体数; S5,对新的校正后表型进行奇异值分解,获得SNPs效应,并基于所述SNPs效应得到基因组预测结果。
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