浙江大学长三角智慧绿洲创新中心范骁辉获国家专利权
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龙图腾网获悉浙江大学长三角智慧绿洲创新中心申请的专利基于单细胞转录组数据的药物响应细胞群排序方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN117116349B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-01-06发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202311052732.0,技术领域涉及:G16B30/00;该发明授权基于单细胞转录组数据的药物响应细胞群排序方法及系统是由范骁辉;邵鑫;李承宇;廖杰设计研发完成,并于2023-08-21向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于单细胞转录组数据的药物响应细胞群排序方法及系统在说明书摘要公布了:本发明提供了一种基于单细胞转录组数据的药物响应细胞群排序方法及系统,涉及药物响应细胞群排序领域,该方法包括:根据已知细胞群类型的疾病状态下的scRNA‑seq数据构建每种细胞群的靶点基因调控网络GRN;根据药物靶点信息虚拟敲除掉所述GRN中的靶点,构建每种细胞群虚拟敲除靶点后的靶点基因调控网络tpGRN;通过流形对齐训练GRN中每个网络节点在GRN以及所述tpGRN中的低维表示;通过欧式距离计算每个网络节点在GRN以及tpGRN中的距离;综合考虑GRN以及tpGRN中药物靶点、2‑hop节点以及2‑hop节点的边的变化趋势对不同细胞群的药物响应进行打分,生成药物扰动分数,以对细胞群的药物响应进行排序,确定药物响应细胞群排序结果。本发明能够提高药物响应细胞群的推断准确度。
本发明授权基于单细胞转录组数据的药物响应细胞群排序方法及系统在权利要求书中公布了:1.一种基于单细胞转录组数据的药物响应细胞群排序方法,其特征在于,包括: 获取已知细胞群类型的疾病状态下的scRNA-seq数据以及药物靶点信息; 根据所述scRNA-seq数据,利用基因的共表达关系构建每种细胞群的靶点基因调控网络GRN; 根据所述药物靶点信息虚拟敲除掉所述GRN中的靶点,构建每种所述细胞群虚拟敲除靶点后的靶点基因调控网络tpGRN; 通过流形对齐训练所述GRN中每个网络节点在所述GRN以及所述tpGRN中的低维表示;所述网络节点为基因节点; 基于所述低维表示,通过欧式距离计算每个所述网络节点在所述GRN以及所述tpGRN中的距离; 基于所述距离,综合考虑所述GRN以及所述tpGRN中药物靶点、2-hop节点以及所述2-hop节点的边的变化趋势对不同细胞群的药物响应进行打分,生成药物扰动分数; 按照所述药物扰动分数对细胞群的药物响应进行排序,确定药物响应细胞群排序结果;所述药物响应细胞群排序结果用于表征所述细胞群对药物扰动后的响应程度。
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