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龙图腾网获悉西安电子科技大学申请的专利一种基于活性片段的靶向配体生成方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN116758977B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-01-02发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202310409171.9，技术领域涉及：G16B15/00；该发明授权一种基于活性片段的靶向配体生成方法是由李朋勇;章楷豪设计研发完成，并于2023-04-17向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种基于活性片段的靶向配体生成方法在说明书摘要公布了：本发明公开了一种基于活性片段的靶向配体生成方法，包括片段序列化过程：基于片段化方法和序列化方法处理用于训练的配体分子得到片段序列；模型训练过程：将配体分子片段序列和用于训练的靶点蛋白质氨基酸序列输入至靶向配体分子生成模型，通过片段序列编码器提取配体分子片段序列的分子表征，并通过靶点编码器提取靶点蛋白质氨基酸序列的靶点表征，特征融合后使用片段序列解码器输出片段序列，并优化模型；靶向配体分子生成过程：将目标靶点蛋白质氨基酸序列输入至训练后的模型，通过靶点编码器提取靶点表征，并通过先验网络预测复合物信息并输入到片段序列解码器，输出片段序列，再基于分子重建方法将片段序列重组为靶向配体分子。

本发明授权一种基于活性片段的靶向配体生成方法在权利要求书中公布了：1.一种基于活性片段的靶向配体生成方法，其特征在于，包括： 片段序列化过程：基于片段化方法和序列化方法处理用于训练的配体分子得到片段序列； 模型训练过程：将配体分子片段序列和用于训练的靶点蛋白质氨基酸序列输入至靶向配体分子生成模型，通过片段序列编码器提取配体分子片段序列的分子表征，并通过靶点编码器提取靶点蛋白质氨基酸序列的靶点表征，特征融合后使用片段序列解码器输出片段序列，并优化靶向配体分子生成模型； 靶向配体分子生成过程：将目标靶点蛋白质氨基酸序列输入至训练后的靶向配体分子生成模型，通过靶点编码器提取靶点表征，并通过先验网络预测复合物信息并输入到片段序列解码器，使用片段序列解码器输出片段序列，再基于分子重建方法将片段序列重组为靶向配体分子； 所述片段化方法包括以下步骤：基于可逆合成化学亚结构物分解规则匹配配体分子中所有可打断的化学键，将所有可打断的化学键断开，对所有可打断的化学键两端的原子分别连接虚拟原子作为断点并进行标记，用于查询任意可打断的化学键两端的片段和片段内断点； 所述靶点编码器被配置为： 基于多头注意力机制的多层Transformer模型对蛋白质氨基酸序列进行编码，得到氨基酸特征序列：将蛋白质氨基酸序列表示为，其中m为氨基酸序列的长度，d为特征维度即氨基酸种类；将Transformer层进行堆叠和残差连接，得到氨基酸特征序列； 基于多层感知器的靶点贡献度感知器得到靶点表征：通过多层感知器的靶点贡献度感知器逐个分析估计氨基酸特征序列与靶点的贡献度，其中Softmax表示归一化指数函数，表示多层感知器，对靶点特征加权求和得到靶点表征； 基于与靶点中心到各残基的距离呈负相关的系数来表达实际贡献度： 其中为第号残基质心到结合位点中心的距离，和为超参数； 基于贡献度损失来最小化贡献度和实际贡献度的KL散度，以引导靶向配体分子生成模型感知靶点信息，重点预测口袋内残基所适配的配体分子。

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