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南方科技大学蒋兴宇获国家专利权

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龙图腾网获悉南方科技大学申请的专利一种嵌合泛素连接酶设计成功的评估方法及应用获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116741263B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-01-02发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310595612.9,技术领域涉及:G16B20/00;该发明授权一种嵌合泛素连接酶设计成功的评估方法及应用是由蒋兴宇;李轩宇;李家安设计研发完成,并于2023-05-24向国家知识产权局提交的专利申请。

一种嵌合泛素连接酶设计成功的评估方法及应用在说明书摘要公布了:本发明属于生物技术领域,公开了一种嵌合泛素连接酶设计成功的评估方法及应用。评估方法:设计嵌合泛素连接酶;构建泛素复合体;利用AF2进行序列比对,计算出5个比对模型,若比对模型同时满足RMSD<2,重叠体积占比<7%,兴趣蛋白的赖氨酸残基与泛素的C端甘氨酸残基之间的最短距离<7nm,则为合格模型;合格模型个数≥2,则嵌合泛素连接酶设计成功。本发明还提出采用上述方法筛选出的嵌合泛素连接酶,及该嵌合泛素连接酶在制备治疗各种疾病的产品中的应用。上述评估方法提出了评估原则,可准确判断嵌合泛素连接酶设计是否成功,并为设计失败的嵌合泛素连接酶的改进提供了理论指导,具有普遍适用性。

本发明授权一种嵌合泛素连接酶设计成功的评估方法及应用在权利要求书中公布了:1.一种嵌合泛素连接酶设计成功的评估方法,其特征在于,包括以下步骤: S1:设计用于靶向降解兴趣蛋白的嵌合泛素连接酶; S2:确定所述嵌合泛素连接酶所属天然E3泛素连接酶的家族,构建所述天然E3泛素连接酶的泛素复合体;所述泛素复合体为天然E3泛素连接酶泛素,所述天然E3泛素连接酶为第二接头蛋白连接蛋白E2泛素接合酶招募结构域; S3:利用AlphaFold2软件计算嵌合泛素连接酶兴趣蛋白复合体的结构,得出5个模型;通过对所述嵌合泛素连接酶与其所属的天然E3泛素连接酶进行序列比对,将所述嵌合泛素连接酶兴趣蛋白复合体定位到所述泛素复合体中,得5个比对模型,评估并记录以下参数:1每个所述模型进行序列比对的均方根偏差RMSD;2在每个所述比对模型中,除比对部分外,所述嵌合泛素连接酶兴趣蛋白复合体与所述连接蛋白的重叠体积占所述连接蛋白体积的比例;3定位后所述兴趣蛋白的赖氨酸残基与所述泛素C端的甘氨酸残基之间的最短距离; S4:评估5个所述比对模型的所述参数是否满足:1RMSD<2;2所述重叠体积占比<7%;3定位后所述兴趣蛋白的赖氨酸残基与所述泛素C端的甘氨酸残基之间的最短距离<7nm;若同时满足上述三个条件,则所述比对模型是合格模型;若上述三个条件中至少有一个不满足,则所述比对模型是不合格模型; S5:统计所述合格模型的个数,若所述合格模型的个数≥2,则所述嵌合泛素连接酶的设计是成功的,能够靶向降解所述兴趣蛋白。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人南方科技大学,其通讯地址为:518055 广东省深圳市南山区桃源街道学苑大道1088号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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