江南大学徐岩获国家专利权
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龙图腾网获悉江南大学申请的专利一种宏病毒组数据的分析方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116682492B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-01-02发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310785999.4,技术领域涉及:G16B25/10;该发明授权一种宏病毒组数据的分析方法是由徐岩;张华东;张红霞设计研发完成,并于2023-06-29向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种宏病毒组数据的分析方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种宏病毒组数据的分析方法,属于宏病毒组学技术领域。所述方法包括:序列质控、序列组装、序列聚类、病毒序列识别、病毒序列检查、病毒丰度计算、物种注释、病毒生活方式判断、病毒宿主预测和病毒辅助代谢基因分析。本发明利用Trimmomatic软件、BWA‑MEN、Megahit软件、CD‑HIT等工具执行宏病毒组数据的分析流程,实践证明本发明能够准确地对病毒物种进行鉴定和注释,全面系统地对宏病毒组数据进行深入解析和挖掘,步骤简洁明了,分析时间短,大幅提高宏病毒鉴定研究效果。
本发明授权一种宏病毒组数据的分析方法在权利要求书中公布了:1.一种宏病毒组数据的分析方法,其特征在于,所述方法包括: 步骤一:序列质控; 使用Trimmomatic软件,去除低质量序列,使用BWA-MEN去除可能存在真核基因组的序列; 步骤二:序列组装和聚类; 使用Megahit软件对所述步骤一获得的序列进行组装,获得contigs序列,使用CD-HIT对所述contigs序列进行去冗余并进行聚类; 步骤三:病毒序列识别和检查; 针对聚类后得到的contigs序列,使用VirSorter2进行病毒序列的识别,使用Check-V检查所述病毒序列的完整性及污染程度; 步骤四:病毒物种注释和丰度计算; 使用Hmmerv3.1b2比对参考蛋白的hmm模型,根据蛋白比对结果进行物种注释,使用BWA软件计算病毒序列的丰度; 步骤五:病毒生活方式判断:使用PhaTYP软件进行病毒生活方式判断; 步骤六:病毒宿主预测:用CRISPRone搜索细菌序列中的CRISPR间隔、tRNA匹配、基因组同源性匹配三种方式对病毒宿主进行预测; 步骤七:病毒辅助代谢基因分析:使用Vibrant和DRAM-V判定病毒编码的辅助代谢基因。
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