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龙图腾网获悉上海交通大学申请的专利重加权算法生成碱基特异性的核酸分子力场参数的方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN115512779B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2026-01-02发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202211168830.6，技术领域涉及：G16C10/00；该发明授权重加权算法生成碱基特异性的核酸分子力场参数的方法是由陈海峰;李政新设计研发完成，并于2022-09-24向国家知识产权局提交的专利申请。

本重加权算法生成碱基特异性的核酸分子力场参数的方法在说明书摘要公布了：本发明涉及一种基于重加权算法生成碱基特异性的核酸分子力场参数的方法，以分子动力学模拟产生的四核苷酸构象是否为错误插层构象为依据，对于核酸核苷重原子的非键参数进行特异性的调整并引入基于格点的能量矫正CMAP参数。本发明在于针对现有RNA分子力场准确度不足的问题，通过重加权算法对于核苷重原子非键参数进行特异性的调整并引入CMAP能量项生成碱基特异性的核酸分子力场参数，提高力场模拟准确度，并通过长时间模拟、副本交换REMD、溶质回火的副本交换REST2对于多个RNA体系进行测试，进一步验证方法与力场参数的有效性。

本发明授权重加权算法生成碱基特异性的核酸分子力场参数的方法在权利要求书中公布了：1.一种基于重加权算法生成碱基特异性的核酸分子力场参数的方法，其特征在于，以分子动力学模拟产生的四核苷酸构象是否为错误插层构象为依据，对于核酸核苷重原子的非键参数进行特异性的调整并引入基于格点的能量矫正参数；包括以下步骤： 1初始分子动力学模拟：基于核酸力场ff99bsc0χOL3参数对于AAAA、CCCC、GGGG、UUUU四个四核苷酸体系进行带溶质回火的副本交换增强采样REST2模拟； 2轨迹分析：提取模拟参考副本轨迹的所有构象，使用DSSR软件分析其碱基堆积顺序，并编写脚本区分是否为错误插层构象； 3重加权调整非键参数：基于构象是否为插层结构，对于四种碱基上核苷重原子的非键参数分别进行特异性的调整； 4再次分子动力学模拟：基于调整后的参数对于AAAA、CAAU、CCCC、GACC、UUUU五个四核苷酸体系进行带溶质回火的副本交换增强采样REST2模拟； 5轨迹分析：提取模拟参考副本轨迹的所有构象，使用DSSR软件分析堆积，并编写脚本区分是否为错误插层构象，同时计算其核苷重原子间的非键能量； 6重加权调整CMAP参数：基于构象是否为插层结构，通过重加权算法引入ζα主链二面角格点能量项； 7获得一套碱基特异性的精准分子力场参数并开展测试。

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