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龙图腾网获悉中国计量大学申请的专利基于三维分子碎片化的药物靶点亲和力预测方法及系统获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN120877844B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-12-30发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202511350397.1，技术领域涉及：G16B15/30；该发明授权基于三维分子碎片化的药物靶点亲和力预测方法及系统是由周建伟;叶敏超;杨牧田设计研发完成，并于2025-09-22向国家知识产权局提交的专利申请。

本基于三维分子碎片化的药物靶点亲和力预测方法及系统在说明书摘要公布了：本发明公开了一种基于三维分子碎片化的药物靶点亲和力预测方法及系统，包括以下步骤：获取待预测的药物分子图结构、待预测的蛋白质分子图结构；对药物分子图结构进行编码，得到药物结构特征向量；对蛋白质分子图结构进行编码，得到蛋白质结构特征向量；对药物分子图结构进行片段特征提取，得到药物片段化结构特征向量；将药物结构特征向量、蛋白质结构特征向量、药物片段化结构特征向量拼接为融合特征向量，输入至预先训练好的药物靶点亲和力预测模型中，得到药物靶点亲和力预测结果。

本发明授权基于三维分子碎片化的药物靶点亲和力预测方法及系统在权利要求书中公布了：1.一种基于三维分子碎片化的药物靶点亲和力预测方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤： 获取待预测的药物分子图结构、待预测的蛋白质分子图结构；所述药物分子图结构包括药物分子中所有原子的三维坐标集合以及元素类型集合，所述蛋白质分子图结构包括蛋白质中所有Cα原子的三维坐标集合以及氨基酸类型集合； 对药物分子图结构进行编码，得到药物结构特征向量；对蛋白质分子图结构进行编码，得到蛋白质结构特征向量；对药物分子图结构进行片段特征提取，得到药物片段化结构特征向量； 将药物结构特征向量、蛋白质结构特征向量、药物片段化结构特征向量拼接为融合特征向量，输入至预先训练好的药物靶点亲和力预测模型中，得到药物靶点亲和力预测结果； 其中，对药物分子图结构进行片段特征提取，得到药物片段化结构特征向量的过程包括： 根据药物分子中原子的三维几何分布进行空间聚类，从而将药物分子中的所有原子划分为若干个原子簇；对每一原子簇对应的簇内原子位置、元素类型进行编码以及非线性变换，得到每一原子簇对应的簇内特征向量；计算每一原子簇对应的几何中心，将每一原子簇对应的几何中心以及簇内特征向量作为簇间图；对簇间图进行编码，得到药物片段化结构特征向量。

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