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广州基迪奥生物科技有限公司周煌凯获国家专利权

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龙图腾网获悉广州基迪奥生物科技有限公司申请的专利一种融合大语言模型的单细胞转录组细胞注释方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119601094B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-12-30发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411755491.0,技术领域涉及:G16B50/10;该发明授权一种融合大语言模型的单细胞转录组细胞注释方法及系统是由周煌凯;高川;艾鹏;孙鹏鹏设计研发完成,并于2024-12-03向国家知识产权局提交的专利申请。

一种融合大语言模型的单细胞转录组细胞注释方法及系统在说明书摘要公布了:本发明提供了一种融合大语言模型的单细胞转录组细胞注释方法及系统,通过构建专有提示词并利用大语言模型进行细胞类型注释,提高了细胞注释的准确性和通用性。本发明对于非模式物种的细胞注释具有显著优势,实现了自动化、智能化的细胞注释流程。

本发明授权一种融合大语言模型的单细胞转录组细胞注释方法及系统在权利要求书中公布了:1.一种融合大语言模型的单细胞转录组细胞注释方法,其特征在于,包括以下步骤: S1,数据预处理: 对新测序得到的单细胞转录组数据进行预处理,包括数据清洗、质量控制和基因表达矩阵的构建; S2,获取并排序各细胞亚群上调基因: 对于给定亚群中的每个基因,使用Wilcoxon秩和检验将其表达值与其他细胞亚群进行比较,以确定各细胞亚群中显著上调的基因,所述显著上调的基因的具体标准为:基因在目标亚群内至少25%的细胞中表达,P值≤0.01且log2倍变化≥0.36; 基于差异分析结果对每个亚群的上调基因进行排序,优先按照P值从小到大排序,当P值相同时,进一步采用差异倍数从大到小排序; S3,非模式物种同源比对: 当注释目标细胞为非模式物种时,需进行同源比对以确定基因symbol号,若目标物种为动物则选择人或小鼠为参考模式物种,若目标物种为植物则选择拟南芥为参考模式物种; 使用BLASTP软件进行同源比对,确定非模式物种与参考模式物种基因之间的同源关系,基于参考模式物种基因的symbol号定义非模式物种的基因symbol号,参数设置为同源性的阈值为E-value1×10-5,Identity≥0.8,根据E-value排序,选择E-value值最小的基因作为来源参考模式物种的同源基因; S4,构建专有提示词: 记录物种、组织、亚群上调排名标记基因名称的信息作为变量,并定义输入和输出格式,构建用于提交给大语言模型的提示词,对于模式物种每个亚群挑选10个排名最靠前的基因构建提示词,对于非模式物种则每个亚群挑选20个排名最靠前的基因构建提示词; S5,提交大语言模型并判断细胞类型: 通过应用程序编程接口API将构建好的提示词提交给大语言模型,重复进行多次问答,汇总大语言模型的答复,根据统计学中的众数概念判定每个亚群对应的细胞类型和标记基因。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人广州基迪奥生物科技有限公司,其通讯地址为:511495 广东省广州市黄埔区国际生物岛螺旋三路12号第七层703单元;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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