吉林大学李瑛获国家专利权
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龙图腾网获悉吉林大学申请的专利基于深度学习的mlncs预测方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116884486B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-12-26发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310889896.2,技术领域涉及:G16B20/50;该发明授权基于深度学习的mlncs预测方法是由李瑛;方文思;孙航;赵家宁;孙睿涵设计研发完成,并于2023-07-19向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于深度学习的mlncs预测方法在说明书摘要公布了:本发明适用于生物信息学领域,提供了基于深度学习的mlncs预测方法,该方法包括以下步骤:步骤1:结合计算方法与深度学习方法构建mlncs正样本集;步骤2:基于SURE强化学习模型,更改输入特征,构建mlncs负样本集;步骤3:利用胶囊网络作为mlncs预测模型,并用构建好的mlncs正样本集和mlncs负样本集进行训练,本发明不需要蛋白质与lncRNA的互作信息,只需要lncRNA的序列信息即可实现预测,通过计算方法、深度学习方法和强化学习方法为mlncs预测工作构建了可靠的正负样本集。
本发明授权基于深度学习的mlncs预测方法在权利要求书中公布了:1.基于深度学习的mlncs预测方法,其特征在于,该方法包括以下步骤: 步骤1:结合计算方法与深度学习方法构建mlncs正样本集; 步骤2:基于SURE强化学习模型,更改输入特征,构建mlncs负样本集; 步骤3:利用胶囊网络作为mlncs预测模型,并用构建好的mlncs正样本集和mlncs负样本集进行训练; 在步骤2中,mlncs负样本筛选模型由负样本筛选器和负样本监督器组成,在强化学习模型训练完成之后,负样本筛选器将拥有从无标签样本中筛选出可靠负样本的能力,将mlncs的无标签样本输入训练好的负样本筛选器,完成对mlncs负样本集的构建; 负样本筛选器包含三个强化学习元素:状态、动作和策略网络; 其中状态为样本i的特征表示,动作属于{0,1}是负样本筛选器对样本i的决策,=0意味着负样本筛选器将样本i视为负样本,ai=1意味着负样本筛选器将样本i视为正样本,策略网络是一个由胶囊网络构建的二分类器,其中为训练过程中需要通过反向传播更新的参数; 在步骤3中,提取lncRNA的序列特征、motif特征、物理化学特征和二级结构特征;每种特征输入至不同的由全连接层构成的特征学习子网,进行高层特征的抽取和维度的统一;特征学习子网输出的高层特征向量组成胶囊,并通过变换矩阵将其投射入相同的高维预测空间;将不同胶囊相加得到新的胶囊,并通过squashing激活函数将向量长度压缩至0-1之间;如果输出向量长度大于0.5,则输入的lncRNA被预测为mlncs;如果输出向量长度小于0.5,则输入的lncRNA被预测为非mlncs。
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