中国人民解放军军事科学院军事医学研究院姜涛获国家专利权
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龙图腾网获悉中国人民解放军军事科学院军事医学研究院申请的专利病毒单基因宿主适应性预测模型的构建方法、设备、介质获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120356519B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-12-16发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510518036.7,技术领域涉及:G16B20/50;该发明授权病毒单基因宿主适应性预测模型的构建方法、设备、介质是由姜涛;李靖;张森;魏俊青;康晓平;冯烨;李裕昌;陈月红设计研发完成,并于2025-04-24向国家知识产权局提交的专利申请。
本病毒单基因宿主适应性预测模型的构建方法、设备、介质在说明书摘要公布了:本发明属于智能医疗领域,具体涉及病毒单基因宿主适应性预测模型的构建方法、设备、介质。方法包括获取训练集病毒单基因数据集和宿主标签,对病毒单基因数据集中的单基因依次进行编码得到编码特征矩阵集,所述编码为:使用滑动窗口法遍历基因序列,窗口内64种不同密码子的频率构成窗口密码子频率向量,以所述窗口密码子频率向量表征窗口的中心密码子,依次将基因序列的各个密码子表征为窗口密码子频率向量;将所述编码特征矩阵集输入残差网络模型得到预测标签,基于预测标签和宿主标签的比较迭代训练,得到单基因宿主适应性预测模型。本申请通过使用对密码子进行表征后训练得到能预测基因适应性的模型,可以实现对基因密码子适应性的分析。
本发明授权病毒单基因宿主适应性预测模型的构建方法、设备、介质在权利要求书中公布了:1.一种流感病毒单基因宿主适应性预测模型的构建方法,其特征在于,所述方法包括: 获取训练集病毒单基因数据集和宿主标签, 对病毒单基因数据集中的单基因依次进行编码得到编码特征矩阵集,所述编码为:将所述单基因的基因序列首尾相连后使用滑动窗口法遍历基因序列,窗口内64种不同密码子的频率构成窗口密码子频率向量,以所述窗口密码子频率向量表征窗口的中心密码子,随着窗口滑动,依次将基因序列的各个密码子表征为当该密码子为中心密码子时的窗口密码子频率向量,遍历结束后得到窗口密码子频率向量构成的编码特征矩阵; 将所述编码特征矩阵集输入神经网络模型得到预测标签,基于预测标签和宿主标签的比较迭代训练得到病毒单基因宿主适应性预测模型; 所述方法包括:滑动窗口的中心密码子表示位于滑动窗口中心位置的密码子; 所述滑动窗口的宽度为S个密码子,如果S为单数,中心密码子为窗口中第S+12个密码子,如果S为双数,中心密码子为窗口中第S2个密码子或第S2个密码子; 当中心密码子在基因序列中的索引小于S2或时,以基因序列的末尾处的密码子补足滑动窗口缺少的密码子,当中心密码子在基因序列中的索引大于n-S时,以基因序列的起始位置的密码子补足滑动窗口缺少的密码子,其中n表示基因序列共包含n个密码子;所述64种不同密码子为标准遗传密码的64种密码子; 对编码特征矩阵集进行自编码学习得到第二编码特征矩阵集,对第二编码特征矩阵集中的编码特征矩阵通过填充0矫正到和编码特征矩阵相同的维度得到第三编码特征矩阵集,将第三编码特征矩阵集和宿主标签输入神经网络模型中迭代训练得到病毒单基因宿主适应性预测模型; 所述对编码特征矩阵集和第三编码特征矩阵集中的矩阵进行表征效果评价后选择表征效果好的矩阵作为最优编码特征矩阵,训练集病毒单基因的最优编码特征矩阵构成最优编码特征矩阵集,将最优编码特征矩阵和宿主标签输入神经网络模型中迭代训练得到病毒单基因宿主适应性预测模型; 所述训练集病毒单基因为下列基因的任意一种:HA、NA、M、NS、NP、PB1、PB2、PA,训练后得到对应的病毒单基因宿主适应性预测模型。
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