中国人民解放军军事科学院军事医学研究院李靖获国家专利权
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龙图腾网获悉中国人民解放军军事科学院军事医学研究院申请的专利分节段病毒基因重配宿主适应性预测模型的构建方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120356513B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-12-16发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510518031.4,技术领域涉及:G16B20/00;该发明授权分节段病毒基因重配宿主适应性预测模型的构建方法是由李靖;张森;魏俊青;姜涛;康晓平;冯烨;李裕昌;陈月红设计研发完成,并于2025-04-24向国家知识产权局提交的专利申请。
本分节段病毒基因重配宿主适应性预测模型的构建方法在说明书摘要公布了:本发明属于智能医疗领域,具体涉及分节段病毒基因重配宿主适应性预测模型的构建方法。方法包括获取病毒数据集和宿主标签;对病毒数据集中的病毒的不同基因,基于不同基因的密码子重要性阈值对密码子重要性过滤后得到不同基因的关键密码子,将不同基因的关键密码子的数据化表征组合后得到病毒数据集的模拟序列;将病毒数据集的模拟序列和宿主标签输入神经网络中迭代训练得到病毒基因重配宿主适应性预测模型。基于关键密码子区域实现病毒的模拟重配,并基于病毒重配适应性预测模型预测重配的序列的人适应性,本申请可以较早地从多种重配可能性中及时识别对人威胁较大的重配结果,便于尽早的对人威胁较大的重配结果进行针对性研究预防。
本发明授权分节段病毒基因重配宿主适应性预测模型的构建方法在权利要求书中公布了:1.一种病毒基因的密码子重要性排序方法,其特征在于,所述方法包括: S1:获取表征病毒基因的测试数据集和宿主标签,所述测试数据集中的每个基因数据是基因的每个密码子的数据化表征;测试数据集的数据按照基因密码子首尾相连后进行滑动窗口掩码,其中,末尾是指末尾密码子的数据化表征;密码子的数据化表征的方法为:将单基因的基因序列首尾相连后使用滑动窗口法遍历基因序列,窗口内64种不同密码子的频率构成窗口密码子频率向量,以所述窗口密码子频率向量表征窗口的中心密码子,随着窗口滑动,依次将基因序列的各个密码子表征为当该密码子为中心密码子时的窗口密码子频率向量; S2:通过病毒基因宿主适应性预测模型对测试数据集进行病毒基因宿主适应性预测得到预测的宿主标签,预测的宿主标签与所述宿主标签对比后得到测试集的第一预测准确率;所述病毒基因宿主适应性预测模型是病毒基因的训练数据集训练得到的;训练所用到的标签为序列原始的宿主标签,根据宿主类型不同赋予不同标签; S3:滑动窗口依次掩码第一至第n窗口内的密码子的数据化表征后计算包括每个掩码特征矩阵对应的第二预测准确率,所述第二预测准确率包括掩码第一窗口预测准确率至掩码第n窗口预测准确率的列表,其中n为病毒基因的密码子个数;其中,掩码第一窗口预测准确率的计算方法包括:对测试数据集使用滑动窗口法掩码第一个窗口内的密码子的数据化表征得到第一掩码后的测试数据集,基于第一掩码后的测试数据集进行病毒基因宿主适应性预测得到掩码第一窗口预测的宿主标签,掩码第一窗口预测的宿主标签与所述宿主标签对比后得到掩码第一窗口预测准确率;掩码第n窗口预测准确率与第一窗口预测准确率的计算方式相同,但第n窗口为窗口滑动后的窗口; S4:基于第二预测准确率和第一预测准确率的差值得到掩码第一至第n窗口的区域重要性; S5:将包含每个密码子的窗口的区域重要性求平均后得到每一个向量的重要程度;根据数据化表征中的滑动窗口大小,对每一个向量的重要程度取平均,得到每一个密码子的密码子重要性。
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