中山大学杨建荣获国家专利权
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龙图腾网获悉中山大学申请的专利一种高精度及高覆盖度的谱系树追踪方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116356003B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-12-16发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310540707.0,技术领域涉及:C12Q1/6869;该发明授权一种高精度及高覆盖度的谱系树追踪方法是由杨建荣;陈小舒;陈锋;李梓樟;张晓玉;吴鹏;杨文静设计研发完成,并于2023-05-12向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种高精度及高覆盖度的谱系树追踪方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种高精度及高覆盖度的谱系树追踪方法,本发明涉及细胞谱系追踪技术领域,具体包括以下步骤:选取序列完全不同的单向RNA1、单向RNA2、单向RNA3和单向RNA4备用,选取单细胞克隆扩增制备具有13个编辑位点的谱系条形码备用;采用细胞谱系条形码技术对单向RNA1、单向RNA2、单向RNA3和单向RNA4分别与谱系条形码的13个编辑位点匹配。该高精度及高覆盖度的谱系树追踪方法,增加谱系条形码在所有细胞中的平均表达量,降低了编辑位点被消耗的速度,增加了可追踪时间,同时降低了跨位点缺失突变的比例,获得的细胞谱系树单个叶子的比例高,实现了分辨率为单个细胞级别的谱系树测定方法,降低克隆扩增中细胞的死亡率,以及细胞消化中的损失率。
本发明授权一种高精度及高覆盖度的谱系树追踪方法在权利要求书中公布了:1.一种高精度及高覆盖度的谱系树追踪方法,其特征在于:具体包括以下步骤:S1、选取序列完全不同的单向RNA11、单向RNA22、单向RNA33和单向RNA44备用,选取单细胞克隆扩增制备具有13个编辑位点的谱系条形码5备用; S2、采用细胞谱系条形码技术对单向RNA11、单向RNA22、单向RNA33和单向RNA44分别与谱系条形码5的13个编辑位点匹配,得到谱系条形码5序列; S3、将S1所述的谱系条形码5与绿色荧光蛋白基因及抗性基因组成一个融合基因; S4、采用单细胞测序平台捕获S3所述具有融合基因的谱系条形码5; 在步骤S2中,所述单向RNA11与谱系条形码5的13个编辑位点均有2个以上的错配,单向RNA22、单向RNA33和单向RNA44分别匹配编辑效率较低的第9、12和13编辑位点,依据错配碱基数量及碱基类型的差异,依据CFD技术打分策略,单向RNA11、单向RNA22与谱系条形码5的13个编辑位点的编辑效率逐渐降低。
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