海南省农业科学院畜牧兽医研究所袁靖丽获国家专利权
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龙图腾网获悉海南省农业科学院畜牧兽医研究所申请的专利基于多组学联合分析的肠道菌群功能状态分析方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120432000B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-12-12发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510488507.4,技术领域涉及:G16B20/30;该发明授权基于多组学联合分析的肠道菌群功能状态分析方法及系统是由袁靖丽;孙瑞萍;王军;谭树义;李强设计研发完成,并于2025-04-18向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于多组学联合分析的肠道菌群功能状态分析方法及系统在说明书摘要公布了:本发明公开了基于多组学联合分析的肠道菌群功能状态分析方法及系统,涉及数据分析和微生物技术领域,其技术方案要点是:获取宿主肠道菌群的宏基因组测序数据和代谢组检测数据;构建包含节点和边的互作网络图谱,节点包括代谢物节点和菌群功能通路节点,边为连接代谢物与菌群功能通路的关联线,并确定关联线的关联权重;从互作网络图谱中筛选出关键互作节点;基于关键互作节点量化评估宿主肠道菌群的功能状态。本发明通过整合宏基因组测序数据和代谢组检测数据构建动态互作网络图谱,首次实现了菌群功能通路与代谢产物的时空关联建模,克服了单一组学分析视角局限的技术缺陷,显著提高了功能状态评估的系统性与生物学可解释性。
本发明授权基于多组学联合分析的肠道菌群功能状态分析方法及系统在权利要求书中公布了:1.基于多组学联合分析的肠道菌群功能状态分析系统,其特征在于,包括: 数据获取模块,用于获取宿主肠道菌群的宏基因组测序数据和代谢组检测数据; 图谱构建模块,用于基于所述宏基因组测序数据和所述代谢组检测数据构建包含节点和边的互作网络图谱,所述节点包括代谢物节点和菌群功能通路节点,所述边为连接代谢物与菌群功能通路的关联线,并确定所述关联线的关联权重; 节点筛选模块,用于从所述互作网络图谱中筛选出关键互作节点; 状态评估模块,用于基于所述关键互作节点量化评估所述宿主肠道菌群的功能状态,所述功能状态为代谢活性指数、免疫调节能力指数和或宿主互作风险等级; 所述确定所述关联线的关联权重,包括: 使用核密度估计法计算所述代谢物与所述菌群功能通路之间的互信息; 将代谢物浓度与临床表型输入逻辑回归模型,计算AUC值; 结合所述互信息和所述AUC值确定对应的所述关联线的关联权重; 所述确定所述关联线的关联权重,包括: 确定所述宏基因组测序数据中各个所述菌群功能通路的时序丰度,并以所述时序丰度与对应所述菌群功能通路的历史丰度最大值之比作为第一参数; 确定所述代谢组检测数据中各个所述代谢物的时序浓度,并以所述时序浓度与对应所述代谢物的历史浓度最大值之比作为第二参数; 将所述第一参数与所述第二参数输入长短期记忆网络,确定相应所述关联线的关联权重; 所述从所述互作网络图谱中筛选出关键互作节点,包括: 通过LiNGAM模型分析所述菌群功能通路与所述代谢组的因果方向; 根据所述因果方向计算所述边的因果效应值; 筛选所述因果效应值大于或等于第一阈值的强因果边,与所述强因果边连接的节点作为所述关键互作节点; 所述从所述互作网络图谱中筛选出关键互作节点,包括: 根据所述宏基因组测序数据划分功能子网; 计算所述节点在所述功能子网中的功能协同增益; 筛选所述功能协同增益大于或等于第二阈值的节点作为所述关键互作节点; 或,所述从所述互作网络图谱中筛选出关键互作节点,包括: 根据所述代谢组检测数据中的时序数据评估各个所述节点在动态网络中的时序韧性指数; 筛选所述时序韧性指数大于或等于第三阈值的节点作为所述关键互作节点。
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