中国水稻研究所章孟臣获国家专利权
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龙图腾网获悉中国水稻研究所申请的专利一种基于先验知识的作物种质资源评价方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119068977B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-12-12发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411105836.8,技术领域涉及:G16B20/20;该发明授权一种基于先验知识的作物种质资源评价方法及系统是由章孟臣;杨窑龙;魏兴华;张媛媛;徐群;冯跃设计研发完成,并于2024-08-13向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于先验知识的作物种质资源评价方法及系统在说明书摘要公布了:本申请公开了一种基于先验知识的作物种质资源评价方法及系统,涉及作物种质资源评价技术领域,该方法包括:采集待测种质资源的基因组数据并对其进行变异检测,得到待测种质资源的全基因组遗传变异信息;根据全基因组遗传变异信息和作物性状变异先验知识库,确定待测种质资源的各表型性状的变异评分,从而基于待测种质资源的各表型性状的变异评分,确定待测种质资源的综合变异评分。本申请方法能够根据待测种质资源的基因型数据快速评价其表型性状得分,并结合各个表型性状得分计算综合评分,应用于农作物种质资源评价领域,可极大程度地提高种质资源表型性状评价效率,节约评价成本,从而更好实现种质资源的高效发掘和利用。
本发明授权一种基于先验知识的作物种质资源评价方法及系统在权利要求书中公布了:1.一种基于先验知识的作物种质资源评价方法,其特征在于,包括: 采集待测种质资源的基因组数据;所述待测种质资源的基因组数据包括各基因位点的基因数据; 对所述待测种质资源的基因组数据进行变异检测,得到所述待测种质资源的全基因组遗传变异信息; 根据所述全基因组遗传变异信息和作物性状变异先验知识库,确定所述待测种质资源的各表型性状的变异评分;所述作物性状变异先验知识库包括同类种质资源的基因组数据中,对不同表型性状的变异起决定性作用的各基因位点的权重; 基于所述待测种质资源的各表型性状的变异评分,确定所述待测种质资源的综合变异评分;具体包括:对所述待测种质资源的各表型性状的变异评分求平均值,确定所述待测种质资源的综合变异评分; 通过以下步骤构建作物性状变异先验知识库: 获取若干个已知种质资源的基因组数据;若干个所述已知种质资源与所述待测种质资源为同类种质资源; 根据若干个已知种质资源的基因组数据,分析确定对不同表型性状的变异起决定性作用的基因位点,得到各表型性状的变异位点集; 针对任一表型性状的变异位点集中的任一基因位点,根据所述基因位点对所述表型性状的变异效应大小,确定所述基因位点的权重; 根据各基因位点的权重,构建得到作物性状变异先验知识库; 根据所述全基因组遗传变异信息和作物性状变异先验知识库,确定所述待测种质资源的各表型性状的变异评分,具体包括: 针对任一表型性状,根据所述表型性状的变异位点集,在所述全基因组遗传变异信息中提取对应基因位点的变异数据; 针对所述表型性状的变异位点集中的任一基因位点,根据所述基因位点的变异数据,确定所述基因位点的变异效应类型;变异效应类型包括有利等位变异和其他等位变异; 根据各基因位点的变异效应类型,分别对各基因位点进行计分,得到各基因位点的得分;针对任一基因位点,若所述基因位点的变异效应类型为有利等位变异,则对所述基因位点计分为1,否则对所述基因位点计分为0; 根据所述表型性状的各基因位点的得分和各基因位点的权重,计算得到所述表型性状的变异评分; 根据下式计算表型性状的变异评分: 其中,S为单个表型性状的变异评分,m为所述表型性状的变异位点集中基因位点的个数,k为所述表型性状的变异位点集中基因位点的标号,ak为第k个基因位点的得分,wk为第k个基因位点的权重。
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