华中科技大学同济医学院附属协和医院章小平获国家专利权
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龙图腾网获悉华中科技大学同济医学院附属协和医院申请的专利RNA修饰预测模型构建方法、mRNA及RNA修饰预测方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN118038959B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-12-12发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202410057299.8,技术领域涉及:G16B5/00;该发明授权RNA修饰预测模型构建方法、mRNA及RNA修饰预测方法是由章小平;刘睿杰;王棋设计研发完成,并于2024-01-15向国家知识产权局提交的专利申请。
本RNA修饰预测模型构建方法、mRNA及RNA修饰预测方法在说明书摘要公布了:本发明涉及RNA修饰预测技术领域,特别涉及一种RNA修饰预测模型构建方法、mRNA及RNA修饰预测方法。本发明通过将发生修饰的RNA序列作为正样本序列,将未发生修饰的RNA序列作为负样本序列,构建依次包括嵌入层、transformerencoder层、BiLSTM层、卷积层和全连接层的预测模型。使用正样本序列和负样本序列对预测模型进行训练,确定预测模型的参数数值,使预测模型表现最佳。通过transformerencoder层和BiLSTM层进行特征学习,通过卷积层提取特征,通过全连接层进行拟合。transformerencoder层和BiLSTM层的结合使预测模型具有更好的学习序列特征信息的能力,提高了预测模型的准确度。
本发明授权RNA修饰预测模型构建方法、mRNA及RNA修饰预测方法在权利要求书中公布了:1.mRNA发生N4-乙酰胞苷修饰的预测方法,其特征在于,包括: 获取RNA序列数据,将发生修饰的RNA序列作为正样本序列,将未发生修饰的RNA序列作为负样本序列; 构建预测模型,所述预测模型依次包括嵌入层、transformerencoder层、BiLSTM层、卷积层和全连接层; 使用所述正样本序列和所述负样本序列对所述预测模型进行训练,确定所述预测模型的参数数值,使所述预测模型表现最佳; 通过acRIP-seq得到发生N4-乙酰胞苷修饰的mRNA序列数据库,将其中序列作为第一正样本序列,获取未发生N4-乙酰胞苷修饰的mRNA序列数据库,将其中序列作为第一负样本序列; 将所述第一正样本序列截短,截短操作时保留其中发生N4-乙酰胞苷修饰的序列段;截短操作完成后,所述正样本序列在预设长度范围内均匀分布;将所述第一负样本序列截短,截短操作完成后,所述负样本序列在所述预设长度范围内均匀分布;截短后的所述第一正样本序列和截短后的所述第一负样本序列构成第一数据库; 使用所述第一数据库对所述预测模型进行训练,使所述预测模型表现最佳; 将待预测的mRNA序列输入所述预测模型,得到预测结果。
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