买专利卖专利找龙图腾，真高效！ 查专利查商标用IPTOP,全免费！专利年费监控用IP管家,真方便！

龙图腾网获悉南京格致基因生物科技有限公司申请的专利一种基于软硬件协同计算染色体拷贝数的方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN117275573B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-12-12发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202311380149.2，技术领域涉及：G16B20/10；该发明授权一种基于软硬件协同计算染色体拷贝数的方法是由魏国鹏设计研发完成，并于2023-10-24向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种基于软硬件协同计算染色体拷贝数的方法在说明书摘要公布了：本发明涉及基因测序数据处理技术领域，尤其涉及一种基于软硬件协同计算染色体拷贝数的方法，包括以下步骤：S1、将参考基因组序列R的奇数项或偶数项单独组成一个子集Rc；S2、对子集Rc通过哈希函数建立索引；S3、将基因测序所得的测序序列一条条的映射回到参考基因组的位置上；S4、提取Qo子集的种子集So，在索引表SI中找到的所有候选位置为Lp，确定Q映射到R上的确切位置；S5、完成所有测序数据处理后，统计每一个区块内的测序序列条数，并进行归一化。本发明从算法上创新把标准的由三个独立程序完成的三步计算流程缩减成了一步法，既一个程序直接输出结果，中间没有额外硬盘IO读写，缩短了计算步骤。

本发明授权一种基于软硬件协同计算染色体拷贝数的方法在权利要求书中公布了：1.一种基于软硬件协同计算染色体拷贝数的方法，其特征在于，包括以下步骤： S1、将参考基因组序列R的奇数项或偶数项单独组成一个子集Rc； S2、从Rc的滑动窗口中提取长度为w的种子，使用基于FM-index与哈希函数方法生成种子索引表SI的键值，存储其在参考基因组序列R中的位置； S3、将基因测序所得的测序序列一条条地映射回到参考基因组序列R的位置上，假设一条测序序列为Q，先找到Q正确的起始位置，提取Q的奇数项为Qo，Q的偶数项为Qe，确定能够对应上参考基因组序列R的子集Rc； S4、提取Qo子集的种子集So，在索引表SI中找到的所有候选位置为Lp，确定Q映射到R上的确切位置； S5、完成所有测序数据处理后，统计每一个区块内的测序序列条数，并进行归一化，即可得到染色体拷贝数； 所述S3中确定子集Rc的具体方法为从Qo，Qe的滑动窗口中分别提取长度为w的种子集So及Se，用哈希函数生成这些种子对应的索引表SI的键值，如种子集So在索引表SI中找到的键值数量多于种子集Se在索引表SI中找到的键值数量，则后续处理将使用Qo子集； 所述步骤S4中的具体操作方式为，将Q与Lp中每一个位置对应的R上的序列进行两两对比，对比结果以编辑距离来衡量，距离最小者，为Q的确切位置，如果有多个候选位置同时为最小距离者，则对每一个候选位置对应的区块都增加计数； 将所有候选序列对发送到FPGA板卡的DDR内存中，由FPGA进行后续计算，使用基于位操作的对比算法Bitap算法，在FPGA对所有序列对完成编辑距离计算后，CPU将读取FPGA板卡上DDR内存中的计算结果，并加到对应染色体区块的计数上。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术，可联系本专利的申请人或专利权人南京格致基因生物科技有限公司，其通讯地址为：210000 江苏省南京市江北新区新锦湖路3-1号中丹生态生命科学产业园一期A座1201、1205-1207、1211-1212室；或者联系龙图腾网官方客服，联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。