河南省农业科学院园艺研究所李晓慧获国家专利权
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龙图腾网获悉河南省农业科学院园艺研究所申请的专利用于西瓜育种的基因SNP分子标记方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120412716B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-12-09发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510578441.8,技术领域涉及:G16B20/20;该发明授权用于西瓜育种的基因SNP分子标记方法及系统是由李晓慧;高宁宁;康利允;赵卫星;常高正;李海伦;王慧颖设计研发完成,并于2025-05-07向国家知识产权局提交的专利申请。
本用于西瓜育种的基因SNP分子标记方法及系统在说明书摘要公布了:本申请涉及基因SNP分子标记技术领域,具体涉及用于西瓜育种的基因SNP分子标记方法及系统,该方法包括:分别提取多个品种的西瓜样品的DNA溶液,进行基于SNP分型的指纹图谱构建;获取各西瓜菌群的16SrRNA序列,将各16SrRNA序列划分为各碱基序列;确定各碱基的突变关联参数;以及各16SrRNA序列的转移概率矩阵;修正各16SrRNA序列的采样步长;对所述转移概率矩阵进行修正;确定各16SrRNA序列的特征向量;确定西瓜菌群与土壤样本的16SrRNA序列之间的遗传距离,构建系统发育树,确定各品种西瓜样品的育种环境的强相关菌群。从而提升西瓜育种环境的适配性。
本发明授权用于西瓜育种的基因SNP分子标记方法及系统在权利要求书中公布了:1.用于西瓜育种的基因SNP分子标记方法,其特征在于,该方法包括以下步骤: 分别提取多个品种的西瓜样品的DNA溶液,获取各西瓜品种的DNA溶液的SNP分型数据,构建所述多个品种的西瓜样品的指纹图谱; 获取各西瓜菌群的16S rRNA序列,将各16S rRNA序列划分为固定长度的碱基序列;从指纹图谱中筛选出能够对所述多个品种进行完全区分的各SNP标记; 基于所述多个品种的西瓜样品在所述各SNP标记上的碱基片段中碱基的突变频率,以及指纹图谱中所述各SNP标记的碱基片段的数量在所有所述SNP标记中的碱基片段的数量的占比,确定各碱基的突变关联参数; 分析各16S rRNA序列中各碱基序列的转移概率,确定各16S rRNA序列的转移概率矩阵;通过所有碱基的突变关联参数,修正各16S rRNA序列的采样步长;结合所述转移概率矩阵与所述采样步长,采用随机采样算法,对所述转移概率矩阵进行修正; 利用修正后的转移概率矩阵中的各转移概率,以及各16S rRNA序列中各碱基序列的出现频率,确定各16S rRNA序列的特征向量; 获取所述多个品种的西瓜样品对应的土壤样本,提取土壤样本的16S rRNA序列;基于西瓜菌群与土壤样本的16S rRNA序列的特征向量之间的相关性,确定西瓜菌群与土壤样本的16S rRNA序列之间的遗传距离,构建所述多个品种的西瓜育种环境菌群的系统发育树,确定各品种西瓜样品的育种环境的强相关菌群。
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