中国农业科学院生物技术研究所谷晓峰获国家专利权
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龙图腾网获悉中国农业科学院生物技术研究所申请的专利基于机器学习的基因表达和细胞微观表型的关联方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119560028B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-12-09发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411607421.0,技术领域涉及:G16B40/00;该发明授权基于机器学习的基因表达和细胞微观表型的关联方法是由谷晓峰;毛益超;田键;李东维;谢上;刘翰林设计研发完成,并于2024-11-12向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于机器学习的基因表达和细胞微观表型的关联方法在说明书摘要公布了:本发明提供一种基于机器学习的基因表达和细胞微观表型的关联方法,其中,上述方法包括:获取细胞成像数据与空间转录组数据,其中,细胞成像数据包括目标细胞的细胞核图像;通过微调视觉领域大模型基于细胞核图像与空间转录组数据进行单细胞分割,得到目标细胞的细胞分割图像;基于细胞分割图像确定目标细胞的细胞掩码;对细胞掩码进行定量,得到目标细胞的微观表型;基于目标细胞的细胞掩码与空间转录组数据,确定目标细胞的基因表达;通过预设的机器学习模型,基于目标细胞的微观表型与目标细胞的基因表达进行关联分析,得到目标细胞的微观表型与基因表达关联结果;通过本发明能够实现单细胞的微观表型和基因表达之间的关联。
本发明授权基于机器学习的基因表达和细胞微观表型的关联方法在权利要求书中公布了:1.一种基于机器学习的基因表达和细胞微观表型的关联方法,其特征在于,包括: 获取细胞成像数据与空间转录组数据,其中,所述细胞成像数据包括目标细胞的细胞核图像; 通过微调视觉领域大模型基于所述细胞核图像与所述空间转录组数据进行单细胞分割,得到所述目标细胞的细胞分割图像; 基于所述细胞分割图像确定所述目标细胞的细胞掩码; 对所述目标细胞的细胞掩码进行定量,得到所述目标细胞的微观表型; 基于所述目标细胞的细胞掩码与所述空间转录组数据,确定所述目标细胞的基因表达; 通过预设的机器学习模型,基于所述目标细胞的微观表型与所述目标细胞的基因表达进行关联分析,得到所述目标细胞的微观表型与基因表达关联结果; 所述目标细胞的微观表型包括以下至少之一:细胞面积、细胞周长、细胞最小外接圆半径、细胞最小外接椭圆长轴、细胞最小外接椭圆短轴、细胞最小外接矩形长、细胞最小外接矩形宽; 所述基于所述目标细胞的细胞掩码与所述空间转录组数据,确定所述目标细胞的基因表达,包括: 确定所述目标细胞的每个细胞掩码位置; 基于所述每个细胞掩码位置与所述空间转录组数据进行对齐整合,得到每个细胞掩码位置对应的转录组数据; 将所述每个细胞掩码位置对应的转录组数据,作为所述每个细胞掩码的基因表达; 基于所述目标细胞的每个细胞掩码的基因表达,确定所述目标细胞的基因表达。
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