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中国科学院昆明动物研究所张亚平获国家专利权

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龙图腾网获悉中国科学院昆明动物研究所申请的专利一种构建撒坝猪鉴定SNP位点集的方法及其应用获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119380808B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-25发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411295955.4,技术领域涉及:G16B20/30;该发明授权一种构建撒坝猪鉴定SNP位点集的方法及其应用是由张亚平;王浩;郦雪松;周中银;高云;彭旻晟;施贤设计研发完成,并于2024-09-14向国家知识产权局提交的专利申请。

一种构建撒坝猪鉴定SNP位点集的方法及其应用在说明书摘要公布了:本发明涉及一种构建撒坝猪鉴定SNP位点集的方法及其应用,包括如下步骤:S1、计算撒坝猪的SNP位点品种得分信息;S2、从上述SNP位点中选取撒坝猪SNP位点,使用K‑means聚类方法分为三个聚类簇;S3、对三个聚类簇的SNP位点进一步选取获得撒坝猪鉴定SNP位点集候选位点排序;S4、候选位点选取前30‑40个位点作为撒坝猪的鉴定SNP位点集。本发明提供的构建撒坝猪鉴定SNP位点集的方法及其应用,可从多个猪品系中快速鉴定撒坝猪,或者从多个待测肉制品中快速鉴定撒坝猪肉,鉴定的理论准确度高达99.21%。本发明具有明显的撒坝猪种属特异性,实用性较强,具备良好的开发和应用前景。

本发明授权一种构建撒坝猪鉴定SNP位点集的方法及其应用在权利要求书中公布了:1.一种构建撒坝猪鉴定SNP位点集的方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤: S1、计算撒坝猪的SNP位点品种得分信息:采集撒坝猪血液样品进行全基因组测序,并与IAnimal数据库的各种猪种SNP数据进行汇总,计算所有猪品种SNP位点的品种得分,即遗传差异度Delta、成对群体间遗传分化指数Fst和分配信息度In; S2、从上述SNP位点中选取等位基因型唯一且Delta0.49252或Fst0.14251或In0.77959的撒坝猪SNP位点,并对每个SNP位点的得分值进行标准化处理,根据每个SNP位点标准化得分值使用K-means聚类方法进行分类,分为三个聚类簇,其中簇1的位点中,Fst得分高于均值,Delta和In得分高于均值;簇2的位点中,Fst得分高于均值,Delta和In得分低于均值;簇3的位点中,Fst的得分低于均值,Delta和In高于均值; S3、对S2获得的三个聚类簇的SNP位点,采取如下算法对进行进一步选取: 1计算三个聚类簇中SNP位点共同的中心位点:; 其中,为中心位点,表示第i个位点在第j维的坐标,n为位点总数,j=3; 2计算每个聚类簇中的每个SNP位点与中心位点的距离D: 3迭代选择位点: 按照D从大到小的顺序,依次从簇1、簇2、簇3中选取SNP位点,有序无放回地纳入位点选择区,直到所有位点都被选择,从而将原有的位点重新进行排序,该重新排序的顺序就是撒坝猪鉴定SNP位点集候选位点排序; S4、候选位点的再选择:构建LightGBM模型,对上述撒坝猪鉴定SNP位点集候选位点,选取前30个位点,作为撒坝猪的鉴定SNP位点集。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人中国科学院昆明动物研究所,其通讯地址为:650201 云南省昆明市盘龙区茨坝街道龙欣路17号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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