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复旦大学于肖飞获国家专利权

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龙图腾网获悉复旦大学申请的专利一种新型单细胞TCR测序计算方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN117334256B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-25发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202311210752.6,技术领域涉及:G16B40/30;该发明授权一种新型单细胞TCR测序计算方法是由于肖飞;金哲宇设计研发完成,并于2023-09-20向国家知识产权局提交的专利申请。

一种新型单细胞TCR测序计算方法在说明书摘要公布了:本发明属于单细胞测序技术领域,具体为单细胞TCR测序计算方法。本发明首先在平面直角坐标系中,设定一个滑动矩形,而后对矩形内部的多分组数据进行差异分析,最后将差异分析结果进行整合。根据不同的数据集创建适宜宽度的滑动窗,滑动窗越窄,分析越精确。将滑动窗内不同细胞在各自分组所占比例进行差异分析并记录差异结果,滑动窗继续滑动并持续记录、最终生成差异分析矩阵。通过滑动窗法进行差异分析,可以有效避免由于细胞数目所造成的偏差,因此获取更为精确的分析结果。本发明针对小型数据集有非常好的分析效果。

本发明授权一种新型单细胞TCR测序计算方法在权利要求书中公布了:1.一种单细胞TCR测序计算方法,其特征在于,在平面直角坐标系中,设定一个滑动矩形,而后对矩形内部的多分组数据进行差异分析,最后将差异分析结果进行整合,具体步骤如下: 1将单细胞数据集的基因表达谱进行数值标准化,生成行为基因、列为细胞条形码的单细胞表达矩阵,便于后续对于数据的处理;而后使用主成分分析对数据降维,具体地,首先对数据进行中心化,即每个基因的均值设置为0,而后对去中心化的基因表达数据计算协方差,根据协方差的大小表示该基因对于细胞间差异的贡献程度从而实现对于数据的降维; 2由于不同的细胞类型基因表达不同,根据上述降维后得到的协方差,选取对细胞间差异贡献度最大的前2000个基因作为区分细胞类型的高变基因,将具有相似高变基因的细胞进行聚类,将聚类后的细胞嵌入UMAP坐标系中,在UMAP坐标系中每一个数据点代表1个细胞,在坐标轴上越接近意味着细胞的基因表达水平越接近,被认为是相似的细胞群; 3根据细胞数目以及所需要的分析精度,设置滑动窗的宽度; 4从坐标轴原点开始滑动,在滑动窗内,将来自于不同分组的细胞分别计算TCR在对应分组所占的比例,差异计算公式为: 其中,i和j分别代表不同的分组;sumi表示滑动窗内i分组中TCR的数目,∑i表示i分组中所有TCR的数据,进而得到i分组在滑动窗内TCR占全部细胞TCR的比例,对于j分组同样如此; 5将上述滑动窗内的i分组与j分组的比例差异进行计算,将差值记录在行为差异比例、列为细胞的差异矩阵中; 6随后滑动窗移动至下一位置,重复上述4-5的步骤,直至滑动窗移至坐标系外,或滑动窗内无细胞,随后,根据细胞的条形码将差异矩阵添加至元数据中,滑动窗分析完成。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人复旦大学,其通讯地址为:200433 上海市杨浦区邯郸路220号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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