中国科学院大连化学物理研究所李国辉获国家专利权
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龙图腾网获悉中国科学院大连化学物理研究所申请的专利基于多尺度分子动力学模拟的RNA结构预测方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN117174183B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-25发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202210591379.2，技术领域涉及：G16C10/00；该发明授权基于多尺度分子动力学模拟的RNA结构预测方法是由李国辉;张鼎林;李焱设计研发完成，并于2022-05-27向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于多尺度分子动力学模拟的RNA结构预测方法在说明书摘要公布了：本发明涉及基于多尺度分子动力学模拟的RNA结构预测方法，构建用3个粒子表示一个核苷酸的模型。其中包括该粗粒化模型中各粒子的键联关系方式；该粗粒化模型中各粒子参数的拟合方法；该粗粒化模型与全原子模型映射关系的拟合方法。本发明为用户提供一种基于全原子和粗粒化迭代模拟的RNA结构预测方法。此模型模拟效率比全原子模型更为高效，且在一定程度上保证了全原子的模拟精度。
本发明授权基于多尺度分子动力学模拟的RNA结构预测方法在权利要求书中公布了：1.基于多尺度分子动力学模拟的RNA结构预测方法，其特征在于，包括以下步骤： 1采用RNA序列进行二级结构预测，识别配对的碱基区域，构造出a形双链RNA，对开放的RNA全原子模型以a形双螺旋RNA片段为目标，分段进行拉伸动力学模拟，得到RNA全原子模型运动轨迹； 2构建粗粒化模型，每个核苷酸用3个粗粒化粒子表示； 3拟合所述粗粒化模型中粗粒化粒子的范德华参数以及粗粒化粒子所在位置； 4根据步骤3确定的粗粒化粒子所在位置，得到RNA全原子模型与所述粗粒化模型的映射关系； 5建立所述粗粒化模型中粗粒化粒子的键联关系； 6根据RNA全原子模型运动轨迹、粗粒化粒子的键联关系，拟合所述粗粒化模型中粗粒化粒子的成键参数； 7进行所述粗粒化模型的分子动力学模拟；对于分子动力学模拟产生的构象，通过聚类分析找到最大类的中心作为代表构象，通过拉伸动力学将所述粗粒化模型转变成全原子模型。
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