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成都爱诺言医学检验实验室有限公司葛海获国家专利权

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龙图腾网获悉成都爱诺言医学检验实验室有限公司申请的专利基于NGS技术的HIV-1耐药基因检测方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116612808B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-25发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310495182.3,技术领域涉及:G16B10/00;该发明授权基于NGS技术的HIV-1耐药基因检测方法是由葛海;黄子懿;王超;詹杨丹;张伟;蒋琪琪;蒲秀枚设计研发完成,并于2023-05-05向国家知识产权局提交的专利申请。

基于NGS技术的HIV-1耐药基因检测方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于NGS技术的HIV‑1耐药基因检测方法,属于基因检测技术领域,采用NGS数据质控与过滤、基因组比对与有效信息的提取、构建一致性序列、构建伪参考基因组、HIVdb耐药性检测、NGS测序结果与HIVdb耐药性检测结果的可视化、溯源进化树和最终输出结果等一系列流程完成HIV‑1耐药基因检测,与传统的一代Sanger测序技术相比,采用本发明的系统及方法,可检测到突变频率为10%以下的耐药位点,检测灵敏度更高,对HIV‑1病毒的前期筛查检测及发病后医生制定更为有效的用药方案具有重要意义。

本发明授权基于NGS技术的HIV-1耐药基因检测方法在权利要求书中公布了:1.一种基于NGS技术的HIV-1耐药基因检测方法,其特征在于,包括以下步骤: S1、采用fastqc软件对NGS数据进行质控分析并出具初次质控报告,经过fastp软件过滤NGS数据后,再次用fastqc软件对过滤后的NGS数据进行质控分析并出具二次质控报告,同时,判断质控分析数据是否满足设定要求,若是,则进行后续检测,若否,则提示NGS数据异常及与NGS实验部分关系; S2、采用BWA软件中的mem算法将NGS数据与参考序列进行比对,生成比对文件SAM,使用samtools软件将SAM文件转换为BAM文件,再从BAM文件中提取正确率在99.9%以上的比对结果作为有效信息并排序; S3、采用samtools和ivar软件利用转换得到的BAM文件与参考基因组序列构建一致性基因组序列; S4、伪参考基因组序列构建子模块,用于采用samtools、bcftools和vcfutils软件利用转换得到的BAM文件与参考基因组序列构建伪参考基因组; S5、向一致性基因组序列和伪参考基因组序列输入HIVdb信息进行耐药性检测,得出耐药性结果; S6、生成包含测序深度信息、测序覆盖度信息和测序质控报告的NGS测序结果数据,以及输出一致性的HIVdb耐药性检测结果可视化报告; S7、将构建好的基因组序列与HIVdb数据库的序列进行多序列比对,建立进化树; S8、生成NGS测序结果可视化报告、HIVdb耐药性检测可视化报告、基因组序列或一致性序列或伪参考基因组FASTA文件、比对文件BAM、进化树图片。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人成都爱诺言医学检验实验室有限公司,其通讯地址为:610000 四川省成都市武侯区星狮路818号1栋2单元6层601、602、604号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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