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上海交通大学张雅倩获国家专利权

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龙图腾网获悉上海交通大学申请的专利GC含量局部平衡的DNA存储编码方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116405693B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-25发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310399619.3,技术领域涉及:H04N19/423;该发明授权GC含量局部平衡的DNA存储编码方法是由张雅倩;刘姝;邢朝平设计研发完成,并于2023-04-14向国家知识产权局提交的专利申请。

GC含量局部平衡的DNA存储编码方法在说明书摘要公布了:一种GC含量局部平衡的DNA存储编码方法,采用对原始数据的四元序列编码的同时,采用拼接的方法,对GC含量全局平衡的码字集合做若干次拼接,从而得到新的四元码满足GC含量局部平衡,从而更方便地对应到A、T、C、G构成的四元DNA序列的同时,结合汉明码和VT码,分别纠正碱基替换错误和碱基插入删除错误。进而可以通过挑选汉明码中满足GC含量的码字,最终确保DNA编码的GC含量全局稳定在40%至60%,在每一固定长度滑动窗口下的DNA片段,都满足GC含量稳定在30%至70%。

本发明授权GC含量局部平衡的DNA存储编码方法在权利要求书中公布了:1.一种GC含量局部平衡的DNA存储编码方法,其特征在于,包括以下步骤: 步骤1:获取原始数据信息:将待存储的视频、图像数据的二进制信息序列,每两个比特一组,转化为四元序列待编码; 步骤2:四元汉明码编码:构建包含四个元素的有限域其中:有限域的生成元α满足:α2+α+1=0;利用四元汉明码对步骤1中四元序列待编码进行编码,编码后的码字集合Hamr,4;则其中:汉明码的码长维数极小汉明距离dH=3,r为正整数,表示四元汉明码的余维数; 步骤3:建立有限域到DNA碱基集合{A,T,C,G}的映射关系:0→C,1→G,α→A,α2→T,使得有限域上四元序列的GC含量等同于其中:0和1的含量; 步骤4:获取码字集合Hamr,4中GC含量全局稳定在40%至60%的码字,构成集合 步骤5:对集合进一步编码得到GC含量局部平衡的四元码具体为:选取正整数t≥8,对做t次拼接扩充得到四元码其中:的码长n=tl,码字个数 步骤6:选择四元码的局部参数l′=8l-1,其中:l′表示滑动窗口长度且任意长度l′的滑动窗口下,DNA片段的GC含量均保持在30%至70%,以确保的所有码字满足GC含量局部平衡; 步骤7:建立有限域到四元集合{0,1,2,3}的映射关系:0→0,1→1,α→2,α2→3,将四元码同构地转化为{0,1,2,3}上的四元码 步骤8:利用四元VT码对四元码编码:选取整数a和b为四元VT码的校验参数,其中:0≤a≤n-1,0≤b≤3,通过a,b型四元VT码对编码,得到四元DNA码 步骤9:按照映射关系:0→C,1→G,2→A,3→T,将四元DNA码中的四进制序列转化为由A、T、C、G构成的DNA序列进行存储,序列长度为n; 步骤10:计算四元DNA码的码字个数以及冗余度。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人上海交通大学,其通讯地址为:200240 上海市闵行区东川路800号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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