杭州联川生物技术股份有限公司方超获国家专利权
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龙图腾网获悉杭州联川生物技术股份有限公司申请的专利一种基于划窗映射的基因组测序数据快速注释方法和系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN115631801B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-11发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202211165110.4,技术领域涉及:G16B50/10;该发明授权一种基于划窗映射的基因组测序数据快速注释方法和系统是由方超;郎秋蕾;陈志锋设计研发完成,并于2022-09-23向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于划窗映射的基因组测序数据快速注释方法和系统在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于划窗映射的基因组测序数据快速注释方法和系统,属于生物信息技术领域。本发明首先将所有功能组件的起始位点和终止位点及位于功能组件中的划窗起点和终点构建映射值,并利用该映射值建立索引文件,针对待注释位点,同样获得映射值,进一步在索引文件中搜索映射值,若落在某一功能组件的对应的起点划窗映射值和终点划窗映射值中间,进一步判断所有待注释位点是否落在该功能组件的起始位点和终止位点之间,从而进行注释。利用本发明,可以大大提高搜索注释的效率,降低注释的时间成本和计算成本。
本发明授权一种基于划窗映射的基因组测序数据快速注释方法和系统在权利要求书中公布了:1.一种基于划窗映射的基因组测序数据快速注释方法,其特征在于,包括以下步骤: S1,建立索引文件: 获得测序样本来源物种的功能组件区的起始位点和终止位点,对于每一个功能组件,利用公式1获得映射值: 1 其中,代表第i个位点的映射值,INT表示取整数,代表第i个位点数值,代表第i个位点所属的划窗区间的起始位点,W代表划窗大小,W大小根据所述来源物种的所有功能组件区长度确定, 由此获得所有功能组件区的起始位点和终止位点的映射值以及位于功能组件区内的窗口起点终点的映射值,按下列格式构建索引文件: ChrSEsefunction 其中,Chr代表功能组件区所在染色体位置信息,S代表功能组件区起始位点或者位于功能组件区内的划窗起点的映射值,E代表功能组件区终止位点或者位于功能组件区内的划窗终点的映射值,s代表功能组件区起始位点,function代表功能组件区的类别; S2,获得待注释位点的映射值:其位点数值为Q,同样利用公式1获得待注释位点的映射值G; S3,将步骤S2获得的映射值G在所述索引文件的第2列和第3列进行搜索,若对于某一行j,G满足,判断Q是否满足,若满足,则所述待注释位点可注释位于第j行对应的功能组件区。
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