上海生物制品研究所有限责任公司孙骏获国家专利权
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龙图腾网获悉上海生物制品研究所有限责任公司申请的专利一种基于信号增强预处理的差异化RNA编辑位点精准分析方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120220806B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-07发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510298606.6,技术领域涉及:G16B25/10;该发明授权一种基于信号增强预处理的差异化RNA编辑位点精准分析方法是由孙骏;张弛;何筱宇;曾巧西设计研发完成,并于2025-03-13向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于信号增强预处理的差异化RNA编辑位点精准分析方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种检测差异化RNA编辑位点的方法。该方法包括以下步骤:对一组包括两个及以上处理条件的样本集进行高通量测序并比对,获得DNA和RNA测序数据与比对数据;对DNA和RNA比对数据进行初步联合突变检测,获得候选RNA编辑位点;以候选RNA编辑位点为参考,对DNA和RNA比对数据进行正式联合突变检测,获得RNA编辑位点;对RNA编辑位点进行深度计数并形成深度表,使用统计学方法评估每个编辑位点在不同处理条件之间的差异化编辑化程度,从而筛选出具有统计学意义的RNA编辑位点。使用本方法能够高精度、高特异性地识别多种类型的RNA编辑的差异化RNA编辑位点,有助于阐释RNA编辑机制、发现潜在生物标志物及辅助相关疾病的诊断和治疗策略制定。
本发明授权一种基于信号增强预处理的差异化RNA编辑位点精准分析方法在权利要求书中公布了:1.一种检测差异化RNA编辑位点的方法,其特征在于,包括步骤: A提供待检测差异化RNA编辑位点的含有N个样本的独立样本集;其中,N为≥2的正整数; 其中,每个所述独立样本集包括:i每个所述样本的RNA比对数据,所述RNA比对数据是通过将单个样本的RNA测序数据与参考基因组进行比对后获得的,记为第一数据集;ii每个所述样本的DNA比对数据,所述DNA比对数据是通过将单个样本的DNA测序数据与参考基因组进行比对后获得的,并且经过必要的序列信息前处理与碱基质量评分校正,记为第二数据集; B对每个待检测差异化RNA编辑位点的样本的所述第一数据集和所述第二数据集进行联合突变检测,记为第三数据集; 合并每个所述样本的所述第三数据集,从而获得已知RNA编辑位点数据集,记为第四数据集; C将所述第四数据集作为参考输入,对所有样本的所述第一数据集进行碱基质量评分校正;收集所有样本中经碱基质量评分校正后的第一数据集,保留独立样本信息,记为第五数据集; 收集所有样本集中的所述第二数据集,保留独立样本信息,记为第六数据集; D对所述第五数据集和所述第六数据集进行联合突变检测,从而获得候选RNA编辑位点数据集,记为第七数据集; E从每个待检测差异化RNA编辑位点的样本的所述第一数据集中,获取所述第七数据集中每个候选RNA编辑位点的等位基因深度,从而获得每个所述样本的含有候选RNA编辑位点信息与编辑位点深度数据的等位基因深度表,记为第八数据集; F合并每个所述样本的第八数据集,获得总等位基因深度表,记为第九数据集;对所述第九数据集中的所述候选RNA编辑位点信息与编辑位点深度数据进行统计分析,从而确定差异化RNA编辑位点。
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