星希尔生物科技(上海)有限公司李欣泽获国家专利权
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龙图腾网获悉星希尔生物科技(上海)有限公司申请的专利一种基于FCSS预测分子毒性的图神经网络预训练方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN116343942B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-07发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202211683405.0,技术领域涉及:G16C20/30;该发明授权一种基于FCSS预测分子毒性的图神经网络预训练方法及系统是由李欣泽;柳俊宏;刘勇;王鹏磊设计研发完成,并于2022-12-27向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于FCSS预测分子毒性的图神经网络预训练方法及系统在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于FCSS预测分子毒性的图神经网络预训练方法,包括:生成分子图,从而将用于与训练的分子通过增加节点与边的特征的方式转换为分子图;基于FCSS确定一个或多个电子中心,并将电子中心作为电子中心描述符;其中电子中心以杂原子或以双键三键连接的碳原子为中心原子;将一个或多个电子中心进行匹配和编码后获得拓展后的原子序数特征,基于拓展后的原子序数特征将特征从原子序数表征更新为电子中心表征;基于电子中心表征进行预训练,在预训练中多次随机掩蔽用于预训练的分子对应的部分或全部拓展后的原子序数特征并进行预测,获得预测分子毒性的基础图神经网络预训练模型,待预测特征为原子序数或电子中心。还公开对应系统及应用。
本发明授权一种基于FCSS预测分子毒性的图神经网络预训练方法及系统在权利要求书中公布了:1.一种基于FCSS预测分子毒性的图神经网络预训练方法,其特征在于,包括: S1,生成分子图,从而将用于与训练的分子通过增加节点与边的特征的方式转换为分子图; S2,基于FCSS确定一个或多个电子中心,并将所述电子中心作为电子中心描述符;其中所述电子中心以杂原子或以双键三键连接的碳原子为中心原子; S3,将所述一个或多个电子中心进行匹配和编码后获得拓展后的原子序数特征,基于拓展后的原子序数特征将特征从原子序数表征更新为电子中心表征; S4,基于电子中心表征进行预训练,在预训练中多次随机掩蔽用于预训练的分子对应的部分或全部拓展后的原子序数特征并进行预测,获得预测分子毒性的基础图神经网络预训练模型,待预测特征为原子序数或电子中心; S5,基于与下游任务相关的训练集对所述基础图神经网络预训练模型进行微调后获得图神经网络预训练模型,所述图神经网络预训练模型用于预测分子毒性。
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