北京医院常乐获国家专利权
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龙图腾网获悉北京医院申请的专利基于NGS数据识别HLA基因遗传变异的方法、设备及存储介质获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120452533B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-11-04发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510524834.0,技术领域涉及:G16B20/20;该发明授权基于NGS数据识别HLA基因遗传变异的方法、设备及存储介质是由常乐;周琳;王露楠;闫颖;姬慧敏;孙慧珍设计研发完成,并于2025-04-24向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于NGS数据识别HLA基因遗传变异的方法、设备及存储介质在说明书摘要公布了:本发明公开基于NGS数据识别HLA基因遗传变异的方法、设备及存储介质。通过获取个体HLA基因型序列接近的序列作为样本HLA基因参考序列进行HLASNP基因型的精确检出,再对齐在坐标体系下使检出的SNP位点在个体间具有可比性,可更准确地鉴定出具有高研究和诊断价值的疾病易感HLA遗传SNP位点。
本发明授权基于NGS数据识别HLA基因遗传变异的方法、设备及存储介质在权利要求书中公布了:1.一种基于NGS数据识别HLA基因遗传变异的方法,其包括以下步骤: 1提供样本的NGS数据,以基因为单位在HLA参考序列数据库中比对得到与样本HLA基因型较为接近的HLA等位基因序列信息,构建样本HLA基因参考序列,其中所述HLA参考序列数据库包含多个HLA及相关基因的多个等位基因的数据; 2以基因为单位构建样本HLA基因参考序列的标准坐标对齐矩阵,生成基于标准坐标体系的样本文件,其中,所述标准坐标以基于人类参考基因组构建的标准坐标体系HLA参考基因组为参考; 3将样本的NGS数据比对到样本HLA基因参考序列得到样本HLA基因比对数据,其中所述样本HLA基因参考序列为步骤1构建的HLA基因参考序列; 4基于样本HLA基因比对数据计算HLASNP基因型可能性,得到标准VCFv4.2格式的基因型VCF文件,其中,所述样本HLA基因比对数据为步骤3生成的样本HLA基因比对数据; 5基于标准坐标对齐矩阵对基因型VCF文件进行标准坐标化,得到标准VCFv4.2格式的标准坐标化基因型VCF文件,其中,所述标准坐标对齐矩阵为步骤2生成的样本HLA基因参考序列的标准坐标对齐矩阵,所述基因型VCF文件为步骤4生成的基因型VCF文件; 6重复步骤1、2、3、4和5得到样本多个基因的标准坐标化基因型VCF文件,合并多个HLA基因文件,生成符合VCFv4.2格式的样本基因型VCF文件;和 7基于样本基因型VCF文件识别HLA基因遗传变异。
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