南开大学王刚获国家专利权
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龙图腾网获悉南开大学申请的专利一种高通量基因组序列数据压缩并行优化方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN117059181B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-10-31发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310739800.4,技术领域涉及:G16B50/50;该发明授权一种高通量基因组序列数据压缩并行优化方法是由王刚;孙辉;刘晓光;郑营锋;王潇霏;赵思浓设计研发完成,并于2023-06-21向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种高通量基因组序列数据压缩并行优化方法在说明书摘要公布了:本发明涉及数据压缩存储技术领域,提供一种高通量基因组序列数据压缩并行优化方法,该方法包括:对待压缩数据集中的字符串类型序列数据并行进行序列特征提取,获得待压缩数据的序列特征值;根据序列特征值构建待压缩数据的特征向量,引入纠正参数和骰子系数并行计算任意所述特征向量间的相似度;根据相似度对待压缩数据集文件进行两级参数选取策略的聚类分簇;根据聚类结果对待压缩数据集进行并行级联压缩,获得优化后的压缩存储文件;对压缩存储文件并行级联解压缩,根据聚类分簇中间文件恢复数据集的原始序列。该方法通过对基因组测序中的文件数量、序列数目、系统内存和级联压缩算法峰值内存开销进行建模和并行处理,降低了压缩时间开销。
本发明授权一种高通量基因组序列数据压缩并行优化方法在权利要求书中公布了:1.一种高通量基因组序列数据压缩并行优化方法,其特征在于,包括: S100:对待压缩数据集中的字符串类型序列数据并行进行序列特征提取,获得待压缩数据的序列特征值; S200:根据所述序列特征值构建待压缩数据的特征向量,引入纠正参数和骰子系数并行计算任意所述特征向量间的相似度; S300:根据所述相似度对待压缩数据集文件进行两级参数选取策略的聚类分簇,获得聚类结果; S400:根据所述聚类结果对待压缩数据集进行并行级联压缩,获得优化后的压缩存储文件; S500:对所述压缩存储文件并行级联解压缩,根据聚类分簇过程的中间文件恢复数据集的原始序列。
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