昆明理工大学张浩轩获国家专利权
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龙图腾网获悉昆明理工大学申请的专利基于超图的协同药物预测方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119943439B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-10-17发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510103197.X,技术领域涉及:G16H70/40;该发明授权基于超图的协同药物预测方法是由张浩轩;戴伟;彭玮设计研发完成,并于2025-01-22向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于超图的协同药物预测方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于超图的协同药物预测方法,属于药物协同组合预测技术领域。该方法首先根据药物组合与细胞系的关系构建超图;其次使用超图节点编码器学习药物特征;接着使用超图超边编码器学习细胞系特征;然后将学习到的两个特征输入超图解码器重建超图计算损失以学习到最优的特征;最后将学习到的特征计算哈达玛积以进行链路预测。本发明能够在不使用任何药物和细胞系特征的前提下,提高协同药物组合预测的准确性,有助于为药物协同组合预测技术领域开阔新的视野。
本发明授权基于超图的协同药物预测方法在权利要求书中公布了:1.一种基于超图的协同药物预测方法,其特征在于,包括如下步骤: Step1:根据药物组合与细胞系的关系,以药物对作为节点,细胞系作为超边,构建超图; Step2:使用超图节点编码器,提取药物特征; Step3:使用超图超边编码器,提取细胞系特征; Step4:将药物特征和细胞系特征输入超图解码器,重建超图并计算损失函数,以学习最优的药物特征和细胞系特征; Step5:根据学习到的最优的药物特征和细胞系特征,进行链路预测; 所述Step4具体为: Step4.1:使用提取到的药物特征和细胞系特征,重构出超图,通过下式计算: ; 其中,为激活函数,T表示矩阵转置操作; Step4.2:计算重构图与原始超图的二进制交叉熵损失,通过下式计算: ; 其中,BCE表示二进制交叉熵函数,具体形式为: ; 其中,表示重建超图后第i个样本的预测值;表示超图第i个样本的真实值; Step4.3:计算药物和细胞系的KL散度损失,通过下式计算: ; ; 其中,表示药物的KL散度,表示细胞系的KL散度,和表示第i个药物的方差和均值,和表示第i个细胞系的方差和均值,表示期望值; Step4.3:对二进制交叉熵损失和KL散度损失进行加和,得到总损失,通过下式计算: ; 其中,为总损失。
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