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海南大学张子龙获国家专利权

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龙图腾网获悉海南大学申请的专利基于图卷积和长短期记忆注意网络的细胞间相互作用重建方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119673277B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-10-17发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411704082.8,技术领域涉及:G16B25/10;该发明授权基于图卷积和长短期记忆注意网络的细胞间相互作用重建方法及系统是由张子龙;杨超;付修豪;崔菲菲设计研发完成,并于2024-11-26向国家知识产权局提交的专利申请。

基于图卷积和长短期记忆注意网络的细胞间相互作用重建方法及系统在说明书摘要公布了:本发明涉及一种基于图卷积和长短期记忆注意网络的细胞间相互作用重建方法及系统。所述方法包括:收集单细胞或亚细胞分辨率下的空间转录组数据,得到各个细胞对应的基因表达矩阵;确定各个细胞之间的空间邻近度,判断细胞之间是否存在相互作用,从而构建得到细胞图;使用图卷积和长短期记忆注意网络进行组合,形成特征提取网络对细胞图进行特征提取,得到潜在特征表示;使用内积对潜在特征表示进行解码,生成新的邻接矩阵,得到重建后的细胞间相互作用。通过引入图卷积和长短期记忆注意网络相结合,在学习细胞间相互作用的同时可以捕捉细胞图结构中的空间相关性,重建出细胞间相互作用,更好了解细胞间的相互作用、研究生物体的组织稳态。

本发明授权基于图卷积和长短期记忆注意网络的细胞间相互作用重建方法及系统在权利要求书中公布了:1.一种基于图卷积和长短期记忆注意网络的细胞间相互作用重建方法,其特征在于,所述方法包括: 收集单细胞或亚细胞分辨率下的空间转录组数据,基于所述空间转录组数据进行转换得到各个细胞对应的基因表达矩阵; 根据所述空间转录组数据确定各个细胞之间的空间邻近度,并基于所述空间邻近度判断细胞之间是否存在相互作用,得到判断结果; 将各个所述细胞作为图结构的顶点,若所述判断结果为细胞之间存在相互作用,则根据空间连接网络为存在相互作用的两个细胞构建图结构的边,将描述细胞和边的矩阵作为邻接矩阵,将各个细胞的所述基因表达矩阵作为图结构的图节点特征,得到节点特征矩阵,并构建得到细胞图; 使用图卷积和长短期记忆注意网络进行组合,形成特征提取网络,包括:将图卷积和长短期记忆注意网络进行串联组合,形成特征提取网络;所述长短期记忆注意网络包括长短期记忆网络、激活函数、注意力机制、跳跃连接;所述长短期记忆网络用于学习细胞之间相互作用的时间依赖性;所述注意力机制用于增强网络的特征表示;所述跳跃连接用于将所述长短期记忆网络的输出特征与所述注意力机制的输出特征相加;所述图卷积用于捕捉图结构的空间相关性,并学习细胞之间的关系;通过所述特征提取网络对所述细胞图进行特征提取,得到潜在特征表示,包括:将所述细胞图输入至所述特征提取网络中,通过所述特征提取网络中的所述长短期记忆注意网络对所述细胞图中的所述特征矩阵进行优化,得到优化后的特征矩阵;将所述优化后的特征矩阵与所述邻接矩阵一起输入到所述图卷积网络中,通过所述图卷积网络捕捉图结构的空间相关性,根据所述图结构的空间相关性得到潜在特征表示,包括:所述图结构的空间相关性经过所述激活函数处理使用跳跃连接与输入的所述特征矩阵相加,捕捉不同层次的特征;将所述不同层次的特征再次输入至所述长短期记忆注意网络和所述图卷积网络中进行编码优化,并经过正则化处理,得到潜在特征表示; 使用内积对所述潜在特征表示进行解码,生成新的邻接矩阵,得到重建后的细胞间相互作用。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人海南大学,其通讯地址为:570100 海南省海口市人民大道58号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

以上内容由龙图腾AI智能生成。

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