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龙图腾网获悉电子科技大学长三角研究院(衢州)申请的专利预测细胞类型特异性的增强子-启动子相互作用的方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN119207588B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-10-14发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202411092630.6，技术领域涉及：G16B40/20；该发明授权预测细胞类型特异性的增强子-启动子相互作用的方法是由刘利;高冬;林昊;邹权设计研发完成，并于2024-08-09向国家知识产权局提交的专利申请。

本预测细胞类型特异性的增强子-启动子相互作用的方法在说明书摘要公布了：本发明提供了一种预测细胞类型特异性的增强子‑启动子相互作用的方法，它解决了预测细胞类型特异性相互作用等问题，其包括如下步骤：S1：数据下载；S2：数据预处理；S3：随机森林预测；S4：特征重要性分析；S5：评价指标；S6：细胞系内交叉验证；S7：细胞系间检验；S8：特征重要性排序。本发明具有细胞类型特异性预测效果好、适用性高等优点。

本发明授权预测细胞类型特异性的增强子-启动子相互作用的方法在权利要求书中公布了：1.一种预测细胞类型特异性的增强子-启动子相互作用的方法，其特征在于，包括如下步骤： S1：数据下载，包括Neu、Ery、Mac0、Mac1、Mac2、Mon、Mk、nCD4、nCD8人类血液细胞PromterCaptureHi-C数据及DNA甲基化和组蛋白修饰H3K4me1、H3K4me3、H3K9me3、H3K27me3、H3K36me3、H3K27ac数据； S2：数据预处理； S21：根据Ensemblv.75，定义转录起始点的上游0.5kb和下游2kb的区域为启动子区域；在RegulatoryBuild的基础上定义了增强子，并在保持原有中心不变的情况下将其修剪或扩展到2.5kb； S22：将启动子和增强子与原数据集中环的两端进行匹配，当且仅当环的一端与一个基因的启动子重叠，另一端与一个注释的增强子重叠时，将其保留作为候选环； S23：将增强子和启动子区域分为5个大小都为0.5kb的片段，并定量每个基因组片段上的组蛋白修饰H3K4me1、H3K4me3、H3K9me3、H3K27me3、H3K27ac、H3K36me3和DNA甲基化修饰信号； S3：随机森林预测； S31：将Bagging算法应用于数据集进行多次随机抽样且不剔除已抽中的样本，得到与原数据样本量相同的新的训练数据集，将其用于训练单颗决策树； S32：在新的训练数据集中随机选择部分特征根据基尼系数对CART决策树的每个节点进行分裂，直至基尼指数为零或无特征可计算，节点无法再分裂； S33：重复步骤S31、S32操作，最终形成由指定数目的决策树构成随机森林，森林中的每颗树自由生长，不进行剪枝操作； S34：输入新的测试数据，每颗决策树都对新的样本进行分类且给出预测结果，对森林中每颗树给出的结果进行统计，最后将出现频率最高的类别作为最终的预测结果； S4：特征重要性分析，计算每个特征在随机森林所有决策树节点分裂时带来的基尼指数减少量的总和； S5：评价指标，采用准确率、召回率、精确度、F1分数和AUC作为加权评估指标； S6：细胞系内交叉验证，将同一细胞系的数据分成10份并轮流作为测试集； S7：细胞系间检验，使用一个细胞系的数据训练模型，然后在其他细胞系上测试； S8：特征重要性排序，综合模型自身的重要性排序、特征与目标的相关性以及特征间的相关性聚类，多维度地分析和筛选关键特征。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术，可联系本专利的申请人或专利权人电子科技大学长三角研究院(衢州)，其通讯地址为：324003 浙江省衢州市柯城区成电路1号；或者联系龙图腾网官方客服，联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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