国科大杭州高等研究院王鑫获国家专利权
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龙图腾网获悉国科大杭州高等研究院申请的专利一种piRNA的分析方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN118599978B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-10-14发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202410514057.7,技术领域涉及:C12Q1/6869;该发明授权一种piRNA的分析方法是由王鑫;魏欢;陈子非设计研发完成,并于2024-04-26向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种piRNA的分析方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种piRNA的分析方法,包括步骤1‑7,本发明针对原始的anti‑MIWIRIP‑seq数据集进行分析即可得到全面而理想的分析结果,无需通过实验手段对piRNA样品进行其他的处理操作,这为生殖领域和RNA领域开展piRNA加尾修饰研究提供了一种有力的生物信息学分析工具。
本发明授权一种piRNA的分析方法在权利要求书中公布了:1.一种piRNA的分析方法,其特征在于,包括以下步骤: 0、对野生型小鼠样本的小RNA的测序reads进行数据质控,所述数据质控包括去除测序reads的3'端序列接头; 1、将小RNA的测序reads与参考基因组进行比对; 2、将1中成功比对的reads进一步与pre-miRNA参考序列比对;对成功比对miRNA的测序reads,通过不同样本miRNA比对reads数量计算标准化参数; 3、对2中未成功比对miRNA的reads去除其他小RNA的污染后与piRNA参考序列比对,所述其他小RNA包括tRNA、rRNA和snRNA; 4、对3中能完全匹配的reads定义为未加尾piRNA,用步骤2中的标准化参数进行标准化; 5、步骤1中未比对成功的reads定义为加尾piRNA,去除其3'末端1nt碱基,然后重复步骤1-3;得到加尾1nt的piRNA; 6、将5中未与参考基因组成功比对的reads再去除3'末端1nt碱基,然后重复步骤1-3;得到加尾2nt的piRNA; 7、按照5和6中的方式进行迭代直至无法获得新加尾的piRNA;然后将所有加尾的piRNA合并并用步骤2的标准化参数进行标准化; 其中,所述参考基因组为小鼠参考基因组。
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