杭州联川生物技术股份有限公司陈哲名获国家专利权
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龙图腾网获悉杭州联川生物技术股份有限公司申请的专利基于元细胞的空间转录组细胞类型注释方法、设备和介质获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120319326B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-10-10发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510814919.2,技术领域涉及:G16B50/10;该发明授权基于元细胞的空间转录组细胞类型注释方法、设备和介质是由陈哲名;车天栋;乔亚娟;张子豪设计研发完成,并于2025-06-18向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于元细胞的空间转录组细胞类型注释方法、设备和介质在说明书摘要公布了:本申请公开了一种基于元细胞的空间转录组细胞类型注释方法、设备和介质,属于生物信息技术领域。所述方法包括以下步骤:将具有细胞类型注释的单细胞组学数据按细胞类型拆分,将同一细胞类型的细胞聚类并生成元细胞,获得元细胞特征计数矩阵;计算各细胞类型相对于其他细胞类型特异性的标志特征;计算各细胞类型标志特征的基矩阵,并基于待注释的空间组学数据的特征计数矩阵,计算每个空间位置对应的细胞类型权重值,取权重值最高的细胞类型作为该空间位置的细胞类型注释。利用本申请的方法、设备或介质进行空间细胞类型注释,大幅度减少了分析过程的计算量,提高了分析效率,增加了注释的准确性和稳定性。
本发明授权基于元细胞的空间转录组细胞类型注释方法、设备和介质在权利要求书中公布了:1.一种基于元细胞的空间组学数据细胞类型注释方法,其特征在于,包括以下步骤: S101,将具有细胞类型注释的单细胞组学数据按细胞类型拆分,将同一细胞类型的细胞聚类并生成元细胞,获得元细胞特征计数矩阵; S102,基于所述元细胞特征计数矩阵,计算各细胞类型相对于其他细胞类型特异性的标志特征,将所有细胞类型的标志特征合并生成标志特征集; S103,基于所述元细胞特征计数矩阵,计算各细胞类型标志特征的基矩阵; S104,基于待注释的空间组学数据的特征计数矩阵,利用所述基矩阵,计算每个空间位置对应的细胞类型权重值,取权重值最高的细胞类型作为该空间位置的细胞类型注释, 其中,步骤S103具体如下: 利用非负矩阵分解算法将所述元细胞特征计数矩阵中所有非标志特征集中的特征剔除,得到元细胞标志特征矩阵,,m表示标志特征数量,表示元细胞数量, 将分解成一个维的基矩阵W和维的第一系数矩阵,即,其中,i表示细胞类型的种类, 步骤S104具体如下: 将待注释的空间组学数据的特征计数矩阵中的所有非标志特征集中的特征剔除,得到空间标志特征计数矩阵,其中,,表示空间位置数量, 基于所述空间标志特征计数矩阵,利用以下公式计算第二系数矩阵, , 其中,为维的矩阵,表示每个空间位置上各种细胞类型的权重值。
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