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湖南工商大学陈晓红获国家专利权

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龙图腾网获悉湖南工商大学申请的专利一种SNP基因型编码方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN115223655B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-10-10发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202210853338.6,技术领域涉及:G16B20/20;该发明授权一种SNP基因型编码方法是由陈晓红;邓泽旺;赵文兵设计研发完成,并于2022-07-20向国家知识产权局提交的专利申请。

一种SNP基因型编码方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种SNP基因型编码方法,包括:获取基因组选择的数据以及基因组注释文件,数据包括SNP输入数据;SNP输入数据包括染色体编号和SNP位置;根据染色体编号和所述SNP位置对数据表格的列进行排序;对数据表格进行预处理,得到SNP编码;对基因组注释文件进行提取,得到SNP类型信息;在数据表格中SNP位置形成SNP列,遍历相邻的SNP列,将SNP列存放至通道内,对通道进行补全;基于SNP类型信息以及SNP编码,对填补后的SNP进行编码,得到样本向量。样本向量可作为卷积神经网络的输入,故而可将基因组注释文件包含的信息运用于深度学习当中。

本发明授权一种SNP基因型编码方法在权利要求书中公布了:1.一种SNP基因型编码方法,其特征在于,包括: S1:获取基因组选择的数据以及基因组注释文件,所述数据包括SNP输入数据;所述SNP输入数据包括染色体编号和SNP位置; S2:根据所述染色体编号和所述SNP位置对数据表格的列进行排序; S3:对数据表格进行预处理,得到SNP编码; S4:对所述基因组注释文件进行提取,得到SNP类型信息; S5:在所述数据表格中所述SNP位置形成SNP列,遍历相邻的所述SNP列,将所述SNP列存放至通道内,对所述通道进行补全; 遍历相邻的所述SNP列,直至相邻的所述SNP列位于不同所述染色体编号时,将其中一列所述SNP列及其之前的所有所述SNP列,抽离至新通道中,记录所述新通道的长度; 对第一次被抽离的所述SNP列进行数据升维,直至所有所述SNP列存放至对应的通道中;按照通道的长度对通道进行排序,以长度最大值的通道的基准,对长度小于长度最大值的通道进行补全,补全至长度等于长度最大值;补全的方式为添加blank列,blank列的值全为-1; S6:基于所述SNP类型信息以及SNP编码,得到样本向量; 再次遍历所述SNP列,将所述SNP编码转换为编码向量,将所述SNP类型信息转换为类型信息向量;将类型信息向量拼接于编码向量后,得到所述样本向量。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人湖南工商大学,其通讯地址为:410205 湖南省长沙市岳麓区湖南工商大学;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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