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龙图腾网获悉华南理工大学申请的专利一种基于高通量测序技术的宿主外源核酸鉴定方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN119541642B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-26发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202410967216.9，技术领域涉及：G16B30/10；该发明授权一种基于高通量测序技术的宿主外源核酸鉴定方法是由庞文定;张艳;金鑫;王菊芳;王斌设计研发完成，并于2024-07-18向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种基于高通量测序技术的宿主外源核酸鉴定方法在说明书摘要公布了：本发明公开了一种基于高通量测序技术的宿主外源核酸鉴定方法。所述方法包括：获取待测样本的测序数据；利用宿主参考基因组数据库，对测序数据进行两次过滤，去除宿主序列；对过滤宿主后的测序数据进行物种分类，减少同源物种序列的干扰；利用鉴定物种参考基因组，进行序列的比对，获得准确的物种序列；将比对上的序列进行低复杂度序列的去除，减少序列偏好性的影响；利用BLAST对物种参考基因组进行二次比对或者比对到NT库上。应用本发明可以准确、特异的鉴定不同宿主样本的外源核酸序列，实现高宿主背景低外源物种生物量样本的有效分析。

本发明授权一种基于高通量测序技术的宿主外源核酸鉴定方法在权利要求书中公布了：1.一种基于高通量测序技术的宿主外源核酸序列鉴定方法，其特征在于，包括如下步骤： S1、获取宿主样本的全基因组测序数据、靶向测序数据或者宏基因组测序数据，对测序数据进行常规质控；所述常规质控指去除测序残留的接头序列以及低质量的测序读长reads；所述低质量的测序读长reads包括N占比大于5%的测序读长reads以及长度小于30的测序读长reads； S2、去除测序数据中的宿主的序列：获取最新的宿主参考基因组，将测序数据中与宿主参考基因组核酸序列相同的核酸序列过滤，完成第一次过滤； S3、将经过第一次过滤后的测序数据中与宿主参考基因组核酸序列相同的核酸序列过滤，完成第二次过滤； S4、指定需要分析的物种，包括寄生虫、微生物不来自于宿主的物种，获取指定分析物种的参考基因组序列，构建物种分类数据库；将经过第二次过滤后的测序数据利用宏基因组分析软件比对到物种分类数据库，获取指定分析物种的准确核酸序列； S5、将指定分析物种的准确分类核酸序列重新比对到指定分析物种的参考基因组序列上，保留成功比对到指定分析物种的参考基因组的双端序列，过滤无法比对上以及单端比对的结果，获得准确物种核酸序列； S6、将准确物种核酸序列中低复杂度的核酸序列去除； S7、利用BLAST比对算法，将去除低复杂度核酸序列后的准确物种核酸序列比对到指定分析物种的参考基因组序列，保留BLAST比对中可信度大于90和覆盖度大于90%的双端序列比对结果，获得可信度高的核酸序列； S8、将可信度高的核酸序列比对到NCBI的NT库上，保留BLAST比对中可信度大于90和覆盖度大于90%的双端序列比对结果，进一步的过滤远缘物种的核酸序列，最终获得真实来自于指定分析物种的核酸序列； S9、若步骤S8中获得的真实来自于指定分析物种的核酸序列和指定分析物种的准确序列相同，则表示宿主样本存在指定分析物种的核酸序列，否则说明宿主样本不存在指定分析物种的核酸序列； 若NCBI的NT库上没有收录指定分析物种的参考基因组序列，会无法产生有效的结果，此时不考虑进行NT库的比对，即不执行步骤S8，直接将步骤S7中获得的可信度高的序列作为指定分析物种的准确序列，然后执行步骤S9，此时没有去除远缘物种序列的干扰。

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