华南师范大学胡敏获国家专利权
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龙图腾网获悉华南师范大学申请的专利一种FRET敏化淬灭转化因子测量数据的处理方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119541650B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-26发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411453354.1,技术领域涉及:G16B40/00;该发明授权一种FRET敏化淬灭转化因子测量数据的处理方法是由胡敏;杜蔓慧;陈同生;孙贝妮设计研发完成,并于2024-10-17向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种FRET敏化淬灭转化因子测量数据的处理方法在说明书摘要公布了:本发明为一种FRET敏化淬灭转化因子测量数据的处理方法,包括步骤:S1、制备FRET样本并采集图像;S2、利用频率直方图确定背景噪声值并扣除;S3、获取信号区域模板图;S4、设置初始滑动窗口,筛选不重叠滑动窗口最多的有效数据区域后求平均值,将平均值代入mPb_G公式计算敏化淬灭转化因子G的平均值和标准差;S5、改变滑动窗口,根据G值的平均值和标准差确定窗口大小;S6、将合适窗口大小下的G值数据绘制为伪彩图和频率直方图,并输出其平均值和标准差。本发明通过采用局部信号识别和均值计算的方法,过滤了细胞信号区域内部和边缘的离散数据点,避免了光学系统噪声以及多通道共定位不准确造成的计算误差。
本发明授权一种FRET敏化淬灭转化因子测量数据的处理方法在权利要求书中公布了:1.一种FRET敏化淬灭转化因子测量数据的处理方法,其特征在于,包括以下步骤: S1、制备FRET样本,采集光漂白前FRET通道AA、DA和DD图像,然后采用短时间高强度激发的方式快速漂白样本,最后采集光漂白后FRET通道AAP和DDP图像;重复上述操作,获取多组活细胞FRET样本图像以获得统计结果; S2、生成若干张样本图像AA、DA、DD、AAP、DDP的灰度值频率直方图,以灰度值频率直方图的第一个非零峰值的灰度值为背景噪声值,逐像素扣除若干张图像的背景噪声,若扣除背景噪声后灰度值小于零,则将其置为零; S3、对光漂白前的AA、DA、DD图像用适当的阈值进行二值化处理,处理后将这些二值化图像相与,得到样本图像的二值化信号区域模板图; S4、设置滑动窗口的大小为n*n,对二值化信号区域模板图进行遍历,采用动态规划的思想在所有信号区域中选取不重叠的最多个数的有效数据窗口;利用二值化信号区域模板图与原始图像的信号区域位置的映射关系,根据选取到的有效数据窗口坐标确定原始图像中有效数据窗口的坐标;对原始图像中每一个窗口内的所有数据点灰度值进行平均,将平均值作为一个数据点代入mPb_G公式进行计算,并将计算结果G值保存在n*n窗口的有效数据列表中; S5、将滑动窗口增大为m*m,其中,m=n+1,重复步骤S4,计算m*m窗口和n*n窗口的有效数据列表中的平均值和标准差,若两者的标准差之差小于各自的标准差,以及两个窗口的变异系数均小于0.3时,数据趋于稳定,不需要再增大滑动窗口;否则,继续增大窗口,重复步骤S4和步骤S5,直到满足条件为止; S6、若数据趋于稳定,将光漂白程度x和敏化淬灭转化因子G的有效数据转化为伪彩图和频率直方图,并输出其平均值; 步骤S4中的有效数据是指在窗口内部所有数据点都是信号点,即所有数据点灰度值均为1,如果其中至少有一个数据点为0,则认为是无效区域;其具体公式为: 其中,Wi表示当前第i个窗口,Grayj表示第j个像素的灰度值,TRUE表示有效区域,FALSE表示无效区域;如果遍历到无效区域,则不对其进行处理,寻找下一个有效区域; 步骤S4中采用动态规划思想在所有信号区域中选取不重叠的最多个数的有效数据窗口,其具体公式为: dpxi,yi,xj,yj=max{dpxi,yi,xj,yj,dpxi,yi,xk,yk+dpxi,yk+1,xk,yj+dpxk+1,yi,xj,yk+dpxk+1,yk+1,xj,yj},i≤k≤j 其中,dpxi,yi,xj,yj表示从左上角xi,yi到右下角xj,yj区间内不重叠的最多个数的有效数据窗口;若当前位置xi,yi的n*n窗口Wi=TRUE,则下一次不重叠的有效数据窗口起点为xi+n,yi+n,否则,下一次不重叠的有效数据窗口起点为xi+1,yi+1。
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