上海百英生物科技股份有限公司杨宇星获国家专利权
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龙图腾网获悉上海百英生物科技股份有限公司申请的专利基于CDR移植的人源化抗体设计的装置、方法和计算机可读存储介质获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119517172B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-26发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411528599.6,技术领域涉及:G16B30/20;该发明授权基于CDR移植的人源化抗体设计的装置、方法和计算机可读存储介质是由杨宇星;卢海松;王辉;徐延镇;常留平设计研发完成,并于2024-10-30向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于CDR移植的人源化抗体设计的装置、方法和计算机可读存储介质在说明书摘要公布了:本发明公开了基于CDR移植的人源化抗体设计的装置、方法和计算机可读存储介质。本发明的方法通过将目标抗原异源抗体的抗原互补决定区序列替换人源化抗体序列的抗原互补决定区序列后得到CDR区域移植抗体;通过对CDR区域移植抗体和异源抗体的差异氨基酸位点进行单氨基酸回复突变后,比较突变前后蛋白三维结构的结构差异性分值;保留结构差异性分值小于等于1的单氨基酸回复突变位点,最终得到目标抗原的CDR移植的人源化抗体。本发明的方法可以增加异源抗体与人源抗体序列的相似度,减少目标抗原人源抗体的免疫原性并维持亲和力。
本发明授权基于CDR移植的人源化抗体设计的装置、方法和计算机可读存储介质在权利要求书中公布了:1.基于CDR区移植的人源化抗体获得的装置,其特征在于:所述装置包括如下模块: A1)人源化框架区的选取模块:用于使用序列比对软件获得特异于目标抗原的异源抗体的人源化抗体序列; A2)CDR区域移植模块:用于使用抗体序列CDR注释系统对所述异源抗体的抗原互补决定区序列进行注释得到异源抗体CDR序列,对所述人源化抗体序列进行注释得到人源化抗体CDR序列;用所述异源抗体CDR序列替换所述人源化抗体序列中的所述人源化抗体CDR序列,得到目标抗原的CDR区域移植抗体序列; A3)回复突变位点的选择和人源化抗体获得模块:用于将所述CDR区域移植抗体的序列与所述异源抗体的序列进行比对获得差异氨基酸位点,分别将所述差异氨基酸位点中的每一个氨基酸位点单独进行回复突变得到单氨基酸回复突变CDR区域移植抗体,使用蛋白结构预测软件对所有所述单氨基酸回复突变CDR区域移植抗体进行结构预测得到所有所述单氨基酸回复突变CDR区域移植抗体的三维结构,使用所述蛋白结构预测软件预测所述异源抗体的三维结构得到异源抗体三维结构; 将所述单氨基酸回复突变CDR区域移植抗体的三维结构和所述异源抗体三维结构使用如下式1进行结构差异性打分得到结构差异性分值; 式1; 式1中,score代表所述单氨基酸回复突变CDR区域移植抗体的三维结构和所述异源抗体三维结构的结构差异性分值;important_score为对所述单氨基酸回复突变CDR区域移植抗体的三维结构和所述异源抗体三维结构基于序列中每个氨基酸残基的B-factor和亲疏水性进行相似度打分得到的数值;exposed_area代表所述异源抗体的三维结构和所述单氨基酸回复突变CDR区域移植抗体的三维结构暴露区域大小的差异值;3D_similarity为所述单氨基酸回复突变CDR区域移植抗体的三维结构和所述异源抗体三维结构的结构相似性分值; 选择所述结构差异性分值小于1的所述单氨基酸回复突变CDR区域移植抗体中的氨基酸突变位点进行合并得到回突组合位点,将所述CDR区域移植抗体序列中的所述回突组合位点位置的氨基酸残基替换为所述异源抗体对应的所述回突组合位点位置的氨基酸残基,得到目标抗原的人源化抗体序列。
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