中国农业科学院北京畜牧兽医研究所王泽昭获国家专利权
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龙图腾网获悉中国农业科学院北京畜牧兽医研究所申请的专利一种肉牛多品种基因组数据分析管理方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120236660B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-26发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510329839.8,技术领域涉及:G16B30/00;该发明授权一种肉牛多品种基因组数据分析管理方法及系统是由王泽昭;李俊雅;李宏伟;高会江;张路培;陈燕;郑彩宏;徐凌洋;朱波;梁忙;李苗设计研发完成,并于2025-03-19向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种肉牛多品种基因组数据分析管理方法及系统在说明书摘要公布了:本发明公开了一种肉牛多品种基因组数据分析管理方法及系统,所述方法包括如下步骤:数据采集与整合:获取肉牛原始基因组序列数据,建立基因组数据存储库,并为每个品种的数据添加唯一的标识标签;数据预处理与标准化:检测变异点并对检测到的变异位点进行标准化处理,同时,对变异位点的基因型数据进行编码处理;多品种基因组特征分析:识别遗传多样性丰富的肉牛品种和相对匮乏的肉牛品种,获得潜在的品种亚群或具有相似遗传背景的品种组合,挖掘在不同品种中普遍存在或特定品种特有的性状关联位点;数据可视化与报告生成:将分析得到的结果进行可视化展示。所述方法能够实现对肉牛多品种基因组数据的全面、系统、高效分析与管理,为肉牛遗传育种提供有力支持。
本发明授权一种肉牛多品种基因组数据分析管理方法及系统在权利要求书中公布了:1.一种肉牛多品种基因组数据分析管理方法,其特征在于包括如下步骤: S1,数据采集与整合:获取肉牛原始基因组序列数据,建立基因组数据存储库,并为每个品种的数据添加唯一的标识标签; S2,数据预处理与标准化:检测变异点并对检测到的变异位点进行标准化处理,同时,对变异位点的基因型数据进行编码处理; S3,多品种基因组特征分析:识别遗传多样性丰富的肉牛品种和相对匮乏的肉牛品种,获得潜在的品种亚群或具有相似遗传背景的品种组合,挖掘在不同品种中普遍存在或特定品种特有的性状关联位点; S4,数据可视化与报告生成:将分析得到的结果进行可视化展示; 所述S2数据预处理与标准化包括如下步骤: 对整合后的多品种基因组数据,进行基因组组装,对于有参考基因组的肉牛品种,将测序数据与参考基因组进行比对,利用比对软件进行比对操作,识别测序数据中的变异位点;对于无参考基因组的肉牛品种,采用从头组装方法,利用软件构建该品种的基因组草图,在此基础上进行变异位点的检测;对检测到的变异位点进行标准化处理,统一变异位点的命名格式和坐标系统,同时,对变异位点的基因型数据进行编码; 所述S3多品种基因组特征分析包括如下步骤: S3-1:基于标准化后的变异位点数据,计算多品种肉牛基因组的遗传多样性指标,用于评估不同品种肉牛群体内和群体间的遗传变异程度,通过比较不同品种的遗传多样性指标,识别遗传多样性丰富的肉牛品种和相对匮乏的肉牛品种; S3-2:进行主成分分析PCA,将高维的基因组变异数据降维到二维空间,展示不同品种肉牛在基因组水平上的分布关系,判断品种间的亲缘关系远近和遗传结构差异;结合聚类分析方法,对肉牛品种进行聚类划分,确定不同品种在基因组层级的分组情况,获得潜在的品种亚群或具有相似遗传背景的品种组合; S3-3:针对与肉牛的重要经济性状相关的基因区域或功能元件,进行全基因组关联分析GWAS,利用混合线性模型检测变异位点与经济性状之间的关联信号,确定与目标性状显著相关的候选基因和变异位点;通过对多品种肉牛数据的综合分析,挖掘出在不同肉牛品种中普遍存在或特定肉牛品种特有的性状关联位点,为肉牛分子标记辅助选择育种提供关键信息。
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