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龙图腾网获悉中国科学院微生物研究所申请的专利一种病毒物种鉴定方法、鉴定系统、设备和介质获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN119920328B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-26发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202510386517.7，技术领域涉及：G16B50/00；该发明授权一种病毒物种鉴定方法、鉴定系统、设备和介质是由吴林寰;张倩;陈奇;郭翀晔;孙清岚;兰宇;范国梅;马俊才;解建雪设计研发完成，并于2025-03-31向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种病毒物种鉴定方法、鉴定系统、设备和介质在说明书摘要公布了：本发明公开了一种病毒物种鉴定方法、鉴定系统、设备和介质，所述方法包括：获取包括非冗余的病毒种和亚种序列的原始参考数据库；将原始参考数据库中序列打断，并和原始参考数据库进行比对，替换原始参考数据库中比对上超过1处的序列得到第一参考数据库；将二代三代测序的原始下机数据比对到第一参考数据库，基于比对丰度鉴定物种；将原始参考数据库的序列打断，和原始参考数据库进行比对，将比对上的序列替换得到第二参考数据库；将拼接后的基因组数据比对到第二参考数据库，基于位分数鉴定物种。本发明设计直接使用reads数据比对策略，并用于病毒物种鉴定的标准化分析流程，本发明能够鉴定的物种多，可精确到亚种水平，鉴定率高且快速。

本发明授权一种病毒物种鉴定方法、鉴定系统、设备和介质在权利要求书中公布了：1.一种病毒物种鉴定方法，其特征在于，包括： 获取原始参考数据库，所述原始参考数据库包括非冗余的病毒种的基因组序列和非冗余的病毒亚种的具有代表性的功能性片段序列； 将所述原始参考数据库中所有序列打断得到若干第一片段，对每个第一片段均使用BWT算法和原始参考数据库进行比对，第一片段比对上的序列超过1处时，将原始参考数据库中比对上的序列段的碱基全部替换为N，得到第一参考数据库； 利用BWT算法将二代或三代测序的原始下机数据比对到第一参考数据库，获得唯一比对上的reads，对所述唯一比对上的reads进行物种丰度统计，最高比对丰度的物种作为鉴定得到的物种； 以第三长度的步长滑动，将所述原始参考数据库中的所有基因组序列打断得到若干第二片段，对每个第二片段均使用BLAST算法和原始参考数据库进行比对，如果第二片段和原始参考数据库中的基因组序列比对相似性达到第一阈值，且比对上的子片段长度不低于第三长度的位置超过1处，则将原始参考数据库中比对上的序列段的碱基全部替换为N，得到第二参考数据库； 使用BLAST算法将拼接后的基因组数据比对到第二参考数据库，bit-score值最高的基因组序列所属物种作为鉴定得到的物种； 所述鉴定方法还包括： 获得待鉴定病毒物种的基因数据； 确定待鉴定病毒物种的基因数据的数据类型，所述数据类型包括拼接后的基因组数据、二代测序的原始下机数据、三代测序的原始下机数据； 所述将所述原始参考数据库中的所有序列打断得到若干第一片段具体为：以第一长度的步长滑动，将所述原始参考数据库中的所有基因组序列按照第二长度打断得到若干第一片段； 所述将所述原始参考数据库中的所有基因组序列打断具体为：将所述原始参考数据库中的所有序列按照第四长度打断得到若干第二片段； 所述第一长度为10bp，第二长度为50bp，第三长度为50bp，第四长度为500bp，第一阈值取值的范围为[98%，100%]。

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