中国科学院微生物研究所陈奇获国家专利权
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龙图腾网获悉中国科学院微生物研究所申请的专利一种全病毒引物的设计与评价的方法、系统和存储介质获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119932234B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-26发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510436102.6,技术领域涉及:C12Q1/70;该发明授权一种全病毒引物的设计与评价的方法、系统和存储介质是由陈奇;孙清岚;周晴;郭翀晔;吴江;吴林寰;马俊才设计研发完成,并于2025-04-09向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种全病毒引物的设计与评价的方法、系统和存储介质在说明书摘要公布了:本发明公开了一种全病毒引物的设计与评价的方法、系统和存储介质,方法包括:获得病毒的病毒基因组序列库;采用方案一或二设计物种鉴定的可用引物,对物种鉴定的可用引物进行物种间验证和宿主验证,对每对物种鉴定的可用引物进行评价;采用方案一或二设计亚型鉴定的可用引物,对亚型鉴定的可用引物进行非目标病毒亚型验证、物种间验证和宿主验证,对每对亚型鉴定的可用引物进行评价。方案二为:对病毒基因组序列库中基因组序列进行多序列比对以鉴定病毒的保守区域,对保守区域进行引物设计,对保守区域的引物进行特异性验证,验证通过率达标的保守区域的引物作为可用引物。本发明提高了引物的准确性,对病毒亚型鉴定引物设计不具有普适性。
本发明授权一种全病毒引物的设计与评价的方法、系统和存储介质在权利要求书中公布了:1.一种全病毒引物的设计与评价的方法,其特征在于,包括: 获得病毒的病毒基因组序列库; 设计物种鉴定的可用引物和或设计亚型鉴定的可用引物; 所述设计物种鉴定的可用引物为:采用方案一或方案二设计物种鉴定的可用引物,对物种鉴定的可用引物进行物种间验证和宿主验证,对每对物种鉴定的可用引物进行评价; 所述设计亚型鉴定的可用引物为:采用方案一或方案二设计亚型鉴定的可用引物,对亚型鉴定的可用引物进行非目标病毒亚型验证、物种间验证和宿主验证,对每对亚型鉴定的可用引物进行评价; 所述方案一为:在病毒基因组序列库中确定病毒的代表基因组,对代表基因组进行引物设计,利用病毒基因组序列库中非代表性基因组对代表基因组的引物进行特异性验证,验证通过率达标的代表基因组的引物作为可用引物; 所述方案二为:对病毒基因组序列库中基因组序列进行多序列比对以鉴定病毒的保守区域,对保守区域进行引物设计,利用病毒基因组序列库对保守区域的引物进行特异性验证,验证通过率达标的保守区域的引物作为可用引物; 所述对物种鉴定的可用引物进行病毒物种间验证和宿主验证包括: 物种鉴定的可用引物在病毒代表性序列数据库的序列中的扩增,并统计扩增情况得到物种鉴定的可用引物的病毒物种间验证结果,所述病毒代表性序列数据库包括多个病毒物种的代表性序列; 物种鉴定的可用引物在宿主基因组数据库的所有宿主基因组上扩增,并统计扩增情况得到物种鉴定的可用引物的宿主验证结果,所述宿主基因组数据库包括病毒的若干个宿主的基因组; 所述对亚型鉴定的可用引物进行非目标病毒亚型验证、病毒物种间验证和宿主验证具体包括: 亚型鉴定的可用引物在非目标亚型的基因组上扩增,并统计扩增情况得到非目标病毒亚型验证结果; 亚型鉴定的可用引物在病毒代表性序列数据库的所有代表性序列上扩增,并统计扩增情况得到亚型鉴定的可用引物的病毒物种间验证结果,所述病毒代表性序列数据库包括多个病毒物种的代表性序列; 亚型鉴定的可用引物在宿主基因组数据库的所有宿主基因组上扩增,并统计扩增情况得到亚型鉴定的可用引物的宿主验证结果,所述宿主基因组数据库包括病毒的若干个宿主的基因组; 所述统计扩增情况是指在验证基因组上能具备扩增效应且扩增位置具备唯一性。
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