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长春大学孙立岩获国家专利权

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龙图腾网获悉长春大学申请的专利基于遗传频控池的冠豪猪算法在GWAS数据上检测SNP组合方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120544669B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-26发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202511036601.2,技术领域涉及:G16B20/20;该发明授权基于遗传频控池的冠豪猪算法在GWAS数据上检测SNP组合方法是由孙立岩;辛翌;郑琳宣设计研发完成,并于2025-07-28向国家知识产权局提交的专利申请。

基于遗传频控池的冠豪猪算法在GWAS数据上检测SNP组合方法在说明书摘要公布了:基于遗传频控池的冠豪猪算法在GWAS数据上检测SNP组合方法,属于计算机数据处理与遗传学交叉技术领域,设计了四种不同的个体生成策略,分别为全局引导策略、协同扰动策略、局部探索策略和收敛加速策略;引入了带频率抑制机制的基因采样模块,即遗传频控池;引入了基于样本量自动推测最大可检测交互阶数的方法;采用K2评分与G检验相结合的显著性检测机制;通过本发明方法显著提升了计算效率和检测精度,有效识别与复杂疾病相关的高阶SNP组合。

本发明授权基于遗传频控池的冠豪猪算法在GWAS数据上检测SNP组合方法在权利要求书中公布了:1.基于遗传频控池的冠豪猪算法在GWAS数据上检测SNP组合方法,其特征在于:命名为GFP-CPO算法,包括以下步骤,且以下步骤顺次进行: 步骤一:将全基因组关联分析GWAS数据加载至内存;通过二进制编码格式保存信息,并使用两个三维数组分别管理病例组和对照组的基因型数据;其中,数组的第一维表示不同的SNP位点,第二维用于区分各类基因型变体,第三维列出拥有该SNP基因型的个体; 步骤二:设定最大上位阶数mo,以及列联表最大长度参数ml,确定GFP-CPO算法在搜索过程中处理的最长SNP组合长度; 步骤三:进行种群个体初始化,以及构建遗传频控池模块,记录种群中各SNP的出现频率; 步骤四:构建改进收敛加速策略,包括四个个体生成策略,分别为全局引导策略、协同扰动策略、局部探索策略和收敛加速策略;设计随机策略选择机制,在每次生成新个体前从四种策略中等概率选取一种;从遗传频控池中按频率引导生成个体,以该个体与当前最优解之间的方向作为扰动方向; 步骤五:计算新生成个体的目标函数的值,采用K2函数作为群体进化的目标,统计各种基因型组合在不同疾病状态下的发生频率,计算条件概率,分析SNP组合与疾病相关性。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人长春大学,其通讯地址为:130022 吉林省长春市卫星路6543号长春大学;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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