中国人民解放军海军军医大学曹广文获国家专利权
买专利卖专利找龙图腾,真高效! 查专利查商标用IPTOP,全免费!专利年费监控用IP管家,真方便!
龙图腾网获悉中国人民解放军海军军医大学申请的专利基于纳米孔测序的未知病原微生物鉴定分析系统及方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119811490B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-16发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411856323.0,技术领域涉及:G16B30/10;该发明授权基于纳米孔测序的未知病原微生物鉴定分析系统及方法是由曹广文;谭晓㛃;丁一波;蒲蕊;任翔宇;施艺玮;刘文斌设计研发完成,并于2024-12-17向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于纳米孔测序的未知病原微生物鉴定分析系统及方法在说明书摘要公布了:本发明基于纳米孔测序的未知病原微生物鉴定分析系统及方法,包括:微生物数据库构建与更新、微生物信息标准化标注、纳米孔测序分析、测序数据质控、宿主测序读段去除、微生物数据库比对注释、同属测序读段组装和微生物数据库比对计算;针对每一个代表性测序读段,将该代表性测序读段与微生物数据库中任一基因组序列进行计算比对,当满足第一计算比对条件,输出该代表性测序读段与满足第一计算比对条件的基因组序列所属的物种一致,当满足第二计算比对条件,输出该代表性测序读段与满足第二计算比对条件的序列所属的物种是同源关系,当该代表性测序读段与微生物数据库中各序列均不满足这两个条件,输出该代表性测序读段在微生物数据库中未比对到。
本发明授权基于纳米孔测序的未知病原微生物鉴定分析系统及方法在权利要求书中公布了:1.一种基于纳米孔测序的未知病原微生物鉴定分析系统,其特征在于,其包括微生物数据库构建与更新模块、微生物信息标准化标注模块、纳米孔测序分析模块、测序数据质控模块、宿主测序读段去除模块、微生物数据库比对注释模块、同属测序读段组装模块和微生物数据库比对计算模块; 所述微生物数据库构建与更新模块用于基于公共数据库获取多条微生物物种信息,每条微生物物种信息至少包括基因组序列,对每条基因组序列进行完整性评估以去除质量较差的基因组序列,针对被保留的各条基因组序列,根据相似性原则去除冗余基因组序列,识别并合并相似性大于设定阈值的多条基因组序列,去冗余后结果为同一物种或相似基因组序列仅保留一个,基于保留的基因组序列所属的微生物物种信息构建微生物数据库,并对微生物数据库进行定期更新; 所述微生物信息标准化标注模块用于依次根据界、门、纲、目、科、属、种的级别属性进行分类,对微生物数据库中的各个微生物物种信息进行物种的标准化分类标注,并在遍历各个微生物物种信息后,发出人工修正提醒信息,以提醒对自动标注好的微生物数据库进行人工修正; 所述纳米孔测序分析模块用于提取待测样品中的全部核酸,核酸为DNA或RNA,DNA经过末端修复或RNA经过逆转录和末端修复得到产物,针对得到的产物利用纳米孔测序平台进行建库和测序,并对纳米孔测序过程进行测序目录实时监控,每当有一个新的测序序列文件产生则将其作为待分析测序序列文件,直至满足纳米孔测序完成的条件或设定时间内未有新的测序序列文件产生,待分析测序序列文件包括多个测序读段; 所述测序数据质控模块用于针对每一待分析测序序列文件,对该待分析测序序列文件中的每一个测序读段均进行去除读段接头污染、去除低质量读段和去除长度短读段的操作,从而获得该待分析测序序列文件中保留下的若干个测序读段; 所述宿主测序读段去除模块用于针对每个待分析测序序列文件中保留下的每个测序读段,均与宿主的基因组序列进行比对,提取出未比对到宿主基因组序列的测序读段; 所述微生物数据库比对注释模块用于将提取出的每个测序读段均与微生物数据库进行比对,在该测序读段与某物种的基因组序列中读段相似度达到设定相似度时,利用该物种的种水平和属水平来对该测序读段进行物种注释,在该测序读段与某物种的基因组序列中读段相似度未达到设定相似度时,去除该测序读段,从而可获得保留下的每个测序读段及其种水平和属水平的物种注释; 所述同属测序读段组装模块用于针对保留下的测序读段,将比对注释到同一属的所有测序读段作为一个读段集合,对同一属的读段集合中所有测序读段进行一致性序列组装以获得若干个代表性测序读段,从而可获得各属下代表性测序读段; 所述微生物数据库比对计算模块用于针对每一个代表性测序读段,将该代表性测序读段与微生物数据库中的任一基因组序列进行计算比对,当满足第一计算比对条件,则输出该代表性测序读段与满足第一计算比对条件的基因组序列所属的物种一致,当满足第二计算比对条件,则输出该代表性测序读段与满足第二计算比对条件的基因组序列所属的物种是同源关系,当该代表性测序读段与微生物数据库中的各个基因组序列均不满足第一计算比对条件和第二计算比对条件,则输出该代表性测序读段在微生物数据库中未比对到的信息。
如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人中国人民解放军海军军医大学,其通讯地址为:200433 上海市杨浦区翔殷路800号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。
1、本报告根据公开、合法渠道获得相关数据和信息,力求客观、公正,但并不保证数据的最终完整性和准确性。
2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解,仅供参考使用,不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。