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龙图腾网获悉山东奔月生物科技股份有限公司申请的专利自动化分子对接及筛选分析方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN120375912B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-16发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202510854524.5，技术领域涉及：G16B15/30；该发明授权自动化分子对接及筛选分析方法是由丁博青;颜富;高升;陈良设计研发完成，并于2025-06-25向国家知识产权局提交的专利申请。

本自动化分子对接及筛选分析方法在说明书摘要公布了：本发明涉及分子对接技术领域，具体涉及自动化分子对接及筛选分析方法，包括如下步骤：S1：蛋白质结构对齐；S2：处理受体蛋白文件；S3：批量分子对接；S4：计算底物‑催化位点的距离；S5：结合能与空间关系联合筛选；S6：结果汇总与可视化。本发明能够高效、准确地完成大规模分子对接任务，为药物设计、酶学研究等领域提供了强大的技术支持。

本发明授权自动化分子对接及筛选分析方法在权利要求书中公布了：1.一种自动化分子对接及筛选分析方法，其特征在于，包括如下步骤： S1：蛋白质结构对齐；批量对齐多个蛋白质结构，确保其与参考结构在空间上的一致性； S2：处理受体蛋白文件；识别活性位点，自动生成对接网格，并优化受体结构；所述S2包括如下子步骤： S2-1：结合分子动力学预处理受体蛋白； S2-2：将对齐后的受体蛋白结构从PDB格式转换为分子对接所需的PDBQT格式，PDBQT文件的生成过程引入受体蛋白的柔性处理； S3：批量分子对接；进行批量对接，自动提取配体结合构象，自动生成蛋白-配体复合物，便于后续分析；所述S3包括如下子步骤： S3-1：生成动态网格，根据受体蛋白的结构特征，计算网格的中心坐标和大小； S3-2：计算网格大小，网格的大小根据活性位点原子的分布范围计算，并添加边界扩展值，以确保配体能够完全覆盖活性位点； S3-3：将参数模板化，通过配置文件实现参数模板化，只需修改模板文件即可批量应用于多个对接任务； S3-4：设置多个对接模式，以探索配体与受体的多种结合构象； S3-5：设置固定的随机种子，确保每次运行的结果可重复； S3-6：为每个受体生成独立的工作文件夹，并将结果汇总到统一的文件中，自动解析对接结果，生成可视化的报告； S4：计算底物-催化位点的距离；计算配体与催化位点关键残基的几何中心距离，筛选最优结合模式； S5：结合能与空间关系联合筛选；结合对接亲和力和催化位点距离进行自动筛选，去除非合理结合模式；所述S5包括如下子步骤： S5-1：结合能筛选，筛选出亲合力排名靠前的20组蛋白质序列； S5-2：底物-催化位点距离筛选；计算底物关键原子到催化位点的最近距离，筛选出距离排名靠前的20组蛋白质序列； S5-3：基于筛选策略，筛选合格的蛋白-配体复合物； 所述S5-3中所述筛选策略如下： 若蛋白-配体复合物的蛋白质与底物的亲合力大于野生型的序列或者底物到活性位点的距离小于野生型的序列，保留，输出筛选结构，否则排除； S6：结果汇总与可视化；生成结合能分布图、距离分布图、计算时间对比图，并导出筛选后的候选分子列表。

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