华东交通大学李光辉获国家专利权
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龙图腾网获悉华东交通大学申请的专利基于序列-结构双通道神经网络的抗菌肽识别方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120432006B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-16发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510938071.4,技术领域涉及:G16B30/00;该发明授权基于序列-结构双通道神经网络的抗菌肽识别方法及系统是由李光辉;王煜新;邓锋;肖湘设计研发完成,并于2025-07-08向国家知识产权局提交的专利申请。
本基于序列-结构双通道神经网络的抗菌肽识别方法及系统在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于序列‑结构双通道神经网络的抗菌肽识别方法及系统,该方法将ProtT5提取的氨基酸特征和氨基酸级手工特征进行拼接,得到肽的嵌入并传入到多个Transformer块组成的序列通道来提取肽的序列特征;利用ESM‑Fold预测肽的三维结构来构建邻接图,将ESM‑2获取的氨基酸特征作为邻接图的节点特征,通过融合多头图注意力、残差网络、层归一化和前馈神经网络的结构通道进行逐层提取与增强;对序列特征和结构特征进行最大池化和拼接,然后用于抗菌肽预测。本发明采用多特征融合策略,同时通过引入抗菌肽的三维结构信息,利用双通道架构融合序列和结构特征,有效提高了抗菌肽识别的准确性。
本发明授权基于序列-结构双通道神经网络的抗菌肽识别方法及系统在权利要求书中公布了:1.一种基于序列-结构双通道神经网络的抗菌肽识别方法,其特征在于,包括以下步骤: 步骤S1:利用预训练的蛋白质语言模型ProtT5、ESM-2分别提取肽序列的氨基酸特征,并利用ESM-Fold预测肽的三维结构;还提取肽序列的结构性质特征和理化性质特征组成的氨基酸级手工特征; 步骤S2:将ProtT5提取的氨基酸特征和氨基酸级手工特征进行拼接,得到肽的嵌入并传入到多个Transformer块组成的序列通道来提取肽的序列特征; 步骤S3:利用肽的三维结构来构建邻接图,将ESM-2提取的氨基酸特征作为邻接图的节点特征,邻接图和节点特征构成肽的图结构特征输入结构通道逐层提取结构特征,所述结构通道采用融合多头图注意力、残差网络、层归一化和前馈神经网络的图注意力编码块; 步骤S4:对提取的序列特征和结构特征分别进行最大池化,并将池化后的两个特征进行拼接; 步骤S5:将拼接后的特征输入到全连接层判断是抗菌肽还是非抗菌肽。
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