北京大学成都前沿交叉生物技术研究院;北京大学伊成器获国家专利权
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龙图腾网获悉北京大学成都前沿交叉生物技术研究院;北京大学申请的专利一种甲基化特征编码模型的处理方法和装置获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN120299532B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-09-12发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510354822.8,技术领域涉及:G16B40/20;该发明授权一种甲基化特征编码模型的处理方法和装置是由伊成器;温翰;贺博;李明阳;顾睿初设计研发完成,并于2025-03-25向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种甲基化特征编码模型的处理方法和装置在说明书摘要公布了:本发明实施例涉及一种甲基化特征编码模型的处理方法和装置,所述方法包括:采集BS‑seq读段集合;根据读段集合进行读段拼接得到第一序列、对第一序列进行五元素序列转换得到第二序列、基于第二序列进行词汇表学习;构建甲基化特征编码模型、序列解码模型、目标来源预测模型;由甲基化特征编码模型和序列解码模型组成预训练模型框架、由甲基化特征编码模型和目标来源预测模型组成第一任务模型框架;对预训练模型框架、第一任务模型框架进行训练;训练结束后基于预训练模型框架处理甲基化序列重构任务、基于第一任务模型框架处理DNA来源识别任务。通过本发明可以提高任务处理实时性、降低任务处理成本。
本发明授权一种甲基化特征编码模型的处理方法和装置在权利要求书中公布了:1.一种甲基化特征编码模型的处理方法,其特征在于,所述方法包括: 为DNA序列中的5-甲基胞嘧啶设置一个对应的拓展标记符记为碱基标记符M,并将DNA的四元碱基集合[A,T,C,G]调整为对应的五元碱基集合[A,T,C,G,M];并对第一物种的亚硫酸氢盐测序读段进行大数据采集组成对应的BS-seq读段集合;并根据所述BS-seq读段集合进行读段拼接得到对应的第一碱基序列;并基于所述五元碱基集合[A,T,C,G,M]和所述第一碱基序列上各碱基标记符C对应的甲基化状态标记对所述第一碱基序列进行五元素序列转换得到对应的第二碱基序列;并基于BPE算法和所述第二碱基序列进行词汇表学习得到对应的第一词汇表; 以MosaicBERT模型为核心构建甲基化特征编码模型;并将所述第一词汇表存入所述甲基化特征编码模型的词表存储模块;并构建一个用于甲基化序列重构的序列解码模型;并基于一类目标来源类型构建一个对应的二分类预测模型记为目标来源预测模型;所述目标来源类型具体为一类组织类型或一类细胞类型; 由所述甲基化特征编码模型和所述序列解码模型组成预训练模型框架;并根据所述第二碱基序列对所述预训练模型框架进行第一框架训练得到对应的编码模型预训练参数; 由所述甲基化特征编码模型和所述目标来源预测模型组成第一任务模型框架;并基于所述BS-seq读段集合和所述目标来源类型构建模型数据集;并基于所述编码模型预训练参数和所述模型数据集对所述第一任务模型框架进行第二框架训练; 第一、第二框架训练结束后,基于所述预训练模型框架处理DNA序列的甲基化序列重构任务;并基于所述第一任务模型框架处理一类与所述目标来源类型对应的DNA序列来源识别任务。
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